| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4583096 | 92 (1.110) | coding (376/3321 nt) | treSB | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGGTGCCAGAAGTACTGGCCGGCGACCGGGTCCCAGGTCCAGTTGGACTTCTCGGTGTCGAGGAAGATGATGCGCGTGCCGTCGTACTTCTGGTCGTCGTCCGACCACACGTAGAACTCGCGCGCCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACGGCCTTGTATTCGG > NC_002947/4582948‑4583242 | cGGTGCCAGAAGTACTGGCCGGCGACCGGGTCCCAGGTCCAGTTGGACTTCTCGGTGTCGAGGAAGATGATGCGCGTGCCGTCGTACTTCTGGTCGTCGTCCGACCACACGTAGAACTCGCGCGCCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGg > 2:884229‑M2/1‑149 (MQ=255)cGGTGCCAGAAGTACTGGCCGGCGACCGGGTCCCAGGTCCAGTTGGACTTCTCGGTGTCGAGGAAGATGATGCGCGTGCCGTCGTACTTCTGGTCGTCGTCCGACCACACGTAGAACTCGCGCGCCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGg > 2:1716919‑M2/1‑149 (MQ=255) gTGCCAGAAGTACTGGCCGGCGACCGGGTCCCAGGTCCAGTTGGACTTCTCGGTGTCGAGGAAGATGATGCGCGTGCCGTCGTACTTCTGGTCGTCGTCCGACCACACGTAGAACTCGCGCGCCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGggc > 1:774995‑M2/1‑147 (MQ=255) 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gcgcgcCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTa < 1:1739448/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTa > 1:1514803/1‑150 (MQ=255) cgcgcCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAg > 1:445906/1‑150 (MQ=255) gcCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAg < 1:1369445/147‑1 (MQ=255) gcCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAg > 2:1369445/1‑147 (MQ=255) cTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAgg < 1:1385258/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAgg < 2:816085/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGgcaaggcgcgcgagttctacgtgtggtcggacgacgaccagaagtacgacggcacgcgcatcatcttcctcgacaccgagaagtccaactggacctgggacccggtcgccggccagtacttctggca < 1:1182389‑M2/150‑128 (MQ=255) ttGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTTGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAAGCAggg > 1:1091922/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTg < 2:611375/78‑1 (MQ=255) ttGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTg > 1:611375/1‑78 (MQ=255) ttGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAATCGGCGGGCGTCGGACATGCTGCCGTAGTCAgcg < 2:622418/150‑3 (MQ=255) tgcCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCa < 1:857208/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACg > 2:865248/1‑150 (MQ=255) cgcgCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACgg < 2:1465287/150‑1 (MQ=255) cgcTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACGGcc < 1:129814/150‑1 (MQ=255) gcTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGAAACCACGGGTGCTTGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACGGCCt > 1:1805695/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACGGCCtt < 1:1364933/150‑1 (MQ=255) cTTGGCGTGCCGGGCGGTGTGTGACGATGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCCGCTCGATCGCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACGGCCtt < 1:1311851/150‑1 (MQ=255) gtggcgGGGGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCCGGTGTGGTTGATGACCAGCTCAGTGATCACCCGCTGCACGCGCTTGTGGGCCGCCGTGAGTAATCTGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGGCAGGGTGCACGGCCTTGTATTc < 1:871765/150‑1 (MQ=255) tggcgGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACGGCCTTGTATTct < 2:1095994/150‑2 (MQ=255) ggcgggcgCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACGGCCTTGTATTCgg < 1:1363553/150‑1 (MQ=255) | CGGTGCCAGAAGTACTGGCCGGCGACCGGGTCCCAGGTCCAGTTGGACTTCTCGGTGTCGAGGAAGATGATGCGCGTGCCGTCGTACTTCTGGTCGTCGTCCGACCACACGTAGAACTCGCGCGCCTTGCTGCCGCGCTTGGCGTGGCGGGCGCGCTGGAACCACGGGTGCTGGTCGCTGGTGTGGTTGATGACCAGCTCGGTGATCACCCGCAGGCCGCGCTTGTGGGCCTCGGCGATGAAACGGCGGGCGTCGGCCATGCTGCCGTAGTCAGGGTGCACGGCCTTGTATTCGG > NC_002947/4582948‑4583242 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |