New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4668931 | 92 (1.040) | 7 (0.080) | 6/238 | NT | 7.0% | coding (757/1533 nt) | nuoM | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
? | NC_002947 | = 4668953 | 97 (1.150) | coding (779/1533 nt) | nuoM | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTA > NC_002947/4668788‑4669079 | tCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCaccga > 1:1052512/1‑150 (MQ=255) tCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCaccga > 2:554139/1‑150 (MQ=255) tCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCac < 1:1594648/147‑1 (MQ=255) ttCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCa > 2:1630295/1‑150 (MQ=255) tCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAg > 1:2080159/1‑150 (MQ=255) cTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGGGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTc > 1:866851/1‑150 (MQ=255) cAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGt < 1:248516/150‑1 (MQ=255) aGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGCGTACGTACTGATGTTGGGCTTCTTCATCGCCTTCTCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTg > 1:989299/1‑150 (MQ=255) gACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGAc > 2:1052512‑M2/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGcaccgagcctgcggtcggtgcctgg < 2:877139‑M1/150‑26 (MQ=255) gCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGc < 2:2080159/150‑1 (MQ=255) gCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGc < 1:1842175/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCCGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCg > 1:2229064/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCgg < 2:2056192/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGt > 1:1929081/1‑150 (MQ=255) gCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATc < 2:2105216/150‑1 (MQ=255) gCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATc > 2:678394/1‑150 (MQ=255) gCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTCGCTG‑CCTGACGCCCAGTCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATc > 1:2250702/1‑150 (MQ=255) 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ccggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAg > 2:1198839/1‑150 (MQ=255) ccggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAg > 2:2000624/1‑150 (MQ=255) ccggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAg < 1:1771717/150‑1 (MQ=255) cggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCTCGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGCAGa > 1:1788759/1‑150 (MQ=255) ggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGAc < 2:989299/150‑1 (MQ=255) ggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCTCGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGCAGACagcg < 2:1788759/150‑1 (MQ=255) tCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCCGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTGTCTTGCTGAAGACCGCGGCCt > 2:1537179/1‑150 (MQ=255) cGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTa < 1:2277508/150‑1 (MQ=255) gAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTg < 1:861726/135‑1 (MQ=255) aGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACg > 2:55448/1‑150 (MQ=255) tACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGAc > 1:1109222‑M2/1‑113 (MQ=255) tACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGc < 1:554139/150‑1 (MQ=255) aCGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTAGTGCTGCGGCCATGGCTCGGCGGGTTTCTCTCCTGGCTG‑CCTGACGCGCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGcc < 1:2271486/150‑1 (MQ=255) tGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCctgc < 1:2000624/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCtgctgc < 2:2229064/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCtgctgc > 1:1434480/1‑150 (MQ=255) 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ccTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGa < 1:55448/150‑1 (MQ=255) tGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGAcc < 2:2118830/150‑1 (MQ=255) tGGCTG‑CCTGACGCCCACG‑CCAGGtccaccgagcctgcggtcggtgcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagcatcagcacgtactcgataccggcc > 2:2051679‑M1/1‑24 (MQ=255) tG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTgg < 2:892795/150‑1 (MQ=255) tGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCt > 1:1276831/1‑150 (MQ=255) aCGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGa > 1:2204233/1‑150 (MQ=255) gCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGAcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagcatcagcacgtactcgataccggccggcaactcggc < 1:2337169‑M2/150‑116 (MQ=255) gCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTgg > 2:1103512/1‑142 (MQ=255) gCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTgg < 1:1103512/142‑1 (MQ=255) tcccGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGGCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCgg > 2:245366/4‑150 (MQ=255) tCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCTGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCgg > 1:513197/1‑150 (MQ=255) cACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGt < 2:1412623/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTAtc < 2:2160322/150‑1 (MQ=255) ccAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGAcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagc < 2:1586695‑M2/107‑81 (MQ=255) ccAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGAcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagc > 1:1586695‑M2/1‑27 (MQ=255) ccAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTAtctt < 2:1177295/150‑1 (MQ=255) ccAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTAtctt > 1:31613/1‑150 (MQ=255) ccAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTAtctt < 2:31613/150‑1 (MQ=255) ccAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTG‑ctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagcatcagcacgtactcgataccggccggcaactcggccttgagcagg < 2:877139‑M2/150‑125 (MQ=255) aGGtccaccgagcctgcggtcggtgcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcac > 1:970420‑M1/1‑3 (MQ=255) aGGtccaccgagcctgcggtcggtgcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcac < 2:970420‑M1/65‑63 (MQ=255) gtccaccgagcctgcggtcggtgcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagcatcagcacgtactcgataccggccggcaactcggccttgagcaggtc > 2:1052512‑M1/1‑1 (MQ=255) gtccaccgagcctgcggtcggtgcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagcatcagcacgta > 1:1109222‑M1/1‑1 (MQ=255) gtccaccgagcctgcggtcggtgcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagcatcagcacgta < 2:1109222‑M1/114‑114 (MQ=255) gCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGc > 1:2201576/1‑132 (MQ=255) | TCACCTTCAACTACAGCGACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTG‑CCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACC‑GCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTA > NC_002947/4668788‑4669079 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |