New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4876493 | 125 (1.420) | 9 (0.110) | 6/222 | NT | 6.8% | intergenic (+286/+151) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
? | NC_002947 | = 4876523 | 136 (1.720) | intergenic (+316/+121) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTAGCGACC > NC_002947/4876344‑4876641 | tAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 1:1039366‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACg > 2:2108431/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACg > 1:1145289/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgg > 1:222498/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgg > 2:1447242/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgg > 2:101221/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCGCCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACggg < 1:1918365/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgggg < 1:846569/150‑1 (MQ=255) tCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg < 2:1041460/150‑1 (MQ=255) gccTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg < 2:1398545/149‑1 (MQ=255) ggggggtggACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCGTGGACAGTTg < 2:2002639/146‑1 (MQ=255) gggggtggACAGTTGGATACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGACAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTgg < 1:737319/147‑1 (MQ=255) gtggtgGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGa < 1:2011916/150‑1 (MQ=255) ggATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgt < 2:1260615‑M2/150‑3 (MQ=255) ggtacAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgta > 2:2019313‑M2/3‑147 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgta > 1:649940‑M2/1‑147 (MQ=255) aTACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACcacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtag < 1:2108431‑M1/150‑35 (MQ=255) aTACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtag > 2:1145289‑M2/1‑146 (MQ=255) 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ccgccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcggg > 1:1933108‑M2/1‑139 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAc < 2:1555935/150‑1 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTCAACCGGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCACACACAAAAATAGTAAGACCTTGTTCTCCACCACAGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAc < 1:2026761/150‑1 (MQ=12) gAGCGGGTCCCCCCGCCAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 1:178114/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa > 2:1757635/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=38) aaCCCGCTCCTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcgcctacggtgaacggcgggtagggattggccaccagggacggcctcttctcgggtgtacccgttcctacggc > 1:404203‑M1/1‑13 (MQ=255) cccGCTCCTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccgggctcttcgcgggtgaacccgctcctacggcgg > 1:214606‑M1/1‑11 (MQ=255) cccGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGAttctt > 1:135297/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGAc > 1:815201/1‑135 (MQ=255) ccGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGAc < 2:815201/135‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGAttcttc > 1:1094481/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATtcttct < 1:466518/150‑1 (MQ=255) cGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATtcttct < 1:1136866/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTa < 1:788654/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGACAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGAGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTa > 1:1376549/1‑150 (MQ=255) tCCTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacggcgggctgt > 2:1295188‑M1/1‑6 (MQ=255) tCCTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgagaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggatttgccagcagggccggcctcttggcgggtgaacttgctccgacggcgggctgt > 2:123347‑M1/1‑6 (MQ=255) tCCTACCACGGGGTTAACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGCGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTAGc < 1:1134098/150‑1 (MQ=255) ccTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggcaggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacggcgggctgta < 1:2222573‑M1/150‑146 (MQ=255) ccTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacggcgggctgta > 1:1520611‑M2/1‑35 (MQ=255) cTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggcca > 1:2062255‑M2/1‑34 (MQ=255) cTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggcca < 2:2062255‑M2/101‑68 (MQ=255) tACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgg > 2:348794‑M1/1‑3 (MQ=255) acgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcg < 1:1335906‑M1/119‑118 (MQ=255) acgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcg > 2:1335906‑M1/1‑2 (MQ=255) ccACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTa > 1:392964/1‑129 (MQ=255) | TAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCA‑CAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACGAAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTAGCGACC > NC_002947/4876344‑4876641 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |