New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1016395 = | 86 (0.970) | 5 (0.060) | 5/234 | NT | 5.4% | coding (714/825 nt) | PP_0876 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 1016444 = | 95 (1.140) | coding (665/825 nt) | PP_0876 | AraC family transcriptional regulator |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GAAATTTGCTTCAGGTAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCGGGTCGAGGTAGGGGCGTTG > NC_002947/1016303‑1016592 | aaaTTTGCTTCAGGTAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTAGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTGGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGtgct > 1:151323/1‑150 (MQ=255) ttCAGGTAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGGTGCAGGCGt > 1:909226/1‑150 (MQ=255) ttCAGGTAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGt > 1:111929/1‑150 (MQ=255) ttCAGGTAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGt > 2:194318/1‑150 (MQ=255) cagatttcctacctgctcaaccaggtgctggggcaaagcttctaccgctacgtcaaccaggcacgcctgcagcacctgaaGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCa > 1:1579616‑M1/81‑133 (MQ=255) cagatttcctacctgctcaaccaggtgctggggcaaagcttctaccgctacgtcaaccaggcacgcctgcagcacctgaaGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCa < 2:1579616‑M1/53‑1 (MQ=255) gTAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGGGGAAGCACGTGTAGAACGCCGACAGCGAGCTGAAGCCGGCACTGAACACACCCTCTCCGGTCGTGGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTg > 1:165660/1‑150 (MQ=255) gTAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCGGGCGTGCCTg > 1:2046169/1‑150 (MQ=255) tAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTgg > 2:1178946/1‑150 (MQ=255) tAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTgg < 2:1973279/150‑1 (MQ=255) tAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGACTgg < 2:392798/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGtt < 1:898018/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGtt < 2:2046169/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTg < 1:1438854/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGa > 2:1620267/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACg > 2:606728/1‑150 (MQ=255) gggCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCCGGCCGGCCAGTTTGACGTa > 2:1009704/1‑150 (MQ=255) gCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAg > 2:852164/1‑121 (MQ=255) 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ttCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGccc > 2:2106978/1‑150 (MQ=255) cgcgGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCa < 1:1178946/150‑1 (MQ=255) aCTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTTACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGt < 2:1952032/150‑1 (MQ=255) aCTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGc < 1:2012193/137‑1 (MQ=255) cTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCTCAGCACCTGGtt < 1:1934655/150‑1 (MQ=255) cTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGtt > 2:150693/1‑150 (MQ=255) cTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGtt < 1:980252/150‑1 (MQ=255) ttGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCg < 2:2247150/122‑1 (MQ=255) ttGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCg > 1:2247150/1‑122 (MQ=255) ttGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTg > 1:1371960/1‑150 (MQ=255) gTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGCGAGCCATCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAg > 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ccagCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGAc < 2:180951/140‑1 (MQ=255) tcgCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCa > 1:1786547/1‑150 (MQ=255) gCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAgg > 2:1448452/1‑150 (MQ=255) gACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCgg < 1:1159130/112‑1 (MQ=255) cTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTcc < 2:1614989/150‑1 (MQ=255) cTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTcc < 1:2022594/150‑1 (MQ=255) tGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCa > 2:908844/1‑72 (MQ=255) tGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCa < 1:908844/72‑1 (MQ=255) gtcgtcGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCgg < 2:301220/150‑1 (MQ=255) cgCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCCGGTTGCCGTAAGGTTAGAATCTTTGCCCCAGCAAATGGTATGGTAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCGGGTCGa < 1:522940/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCgg > 2:1137477/1‑144 (MQ=255) ccGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCgg > 2:1717792/1‑99 (MQ=255) ccGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCgg < 1:1717792/99‑1 (MQ=255) gAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCGGGTCGAGGTa > 2:1619424/1‑150 (MQ=255) tggccATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGc > 2:1569040‑M2/6‑106 (MQ=255) tggccATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGc < 1:1569040‑M2/101‑1 (MQ=255) tggccATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCGGGTCGAGGTAGGGGc > 1:1274632‑M2/6‑150 (MQ=255) ggccATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCGGGTCGAGGTAGGGGCg > 2:575931‑M2/5‑150 (MQ=255) ccATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTc < 2:1318149‑M2/122‑1 (MQ=255) ccATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTc > 1:1318149‑M2/3‑124 (MQ=255) cATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGa < 2:573707‑M2/64‑1 (MQ=255) cATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGa > 1:573707‑M2/2‑65 (MQ=255) cATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGc < 2:1136426‑M2/126‑1 (MQ=255) cATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGc > 1:1136426‑M2/2‑127 (MQ=255) cATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCGGGTCGAGGTAGGGGCGTTg > 1:1625929‑M2/2‑150 (MQ=255) | GAAATTTGCTTCAGGTAGGCCTTGGGCGTGAACCCGGTGTGTTCGCGGAAGCACTTGTAGAACGCCGACAGCGAGTTGAAGCCGGCACTGAAGGCCAGCTCGTCGATCGTCGCCTC‑GACGCTGTCGTCGCCGAGGCTGGCCATCAGGTGCTGCAGGCGTGCCTGGTTGACGTAGCGGTAGAAGCTTTGCCCCAGCACCTGGTTGAGCAGGTAGGAAATCTGGTTGCGGCTGTAGCCGCTGGCGTCGGCGACCTGTTGCAGGTCGAGCTCCGGGTCGAGGTAGGGGCGTTG > NC_002947/1016303‑1016592 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |