| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1149945 | 66 (0.750) | 4 (0.050) +GCCAACACCGT |
4/226 | NT | 5.8% | intergenic (‑186/+71) | PP_1008/gapA | RNA polymerase subunit sigma‑24/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 4333121 = | 76 (0.860) | intergenic (+17/+67) | PP_3804/yaiW | hypothetical protein/lipoprotein | |||||
TGAATCGGCAGTGGCCGAGGTGATCAAGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCAGGCCGTGGTCAGCTTGCGG > NC_002947/4332972‑4333257 | tGAATCGGCAGTGGCCGAGGTGATCAAGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCcgcgcg < 1:546264/150‑1 (MQ=255) aaTCGGCAGTGGCCGAGGTGATCAAGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGt < 2:1876086/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTGATCAAGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACg < 1:1998949/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGATCAAGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGc > 1:1403746/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGccc > 2:57886/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGccc > 2:1987556/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCgtgt < 1:2135628/150‑1 (MQ=255) gcggcCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGGGCGGGCTTCGCCCGTGTTc > 2:1121031/1‑150 (MQ=255) gcCGGGACCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTcgcg < 2:2216766/150‑1 (MQ=255) ccAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGAt < 1:475570/118‑1 (MQ=255) ccAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGAt > 2:475570/1‑118 (MQ=255) ccAAGCAGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGCCCCGCCCGGTGAATCGCCCGGGCTTCCCCCGTGTACGCGGGTAAAc > 2:373120/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAAcc > 2:1891206/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAAcc > 1:1038695/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCg < 1:2131419/150‑1 (MQ=255) tggtggtggtggAGAGTGACCCTGCCGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:1230373/1‑150 (MQ=255) gtggtggtggAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGACAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCaa < 2:43006/150‑1 (MQ=255) actggatgccgtttgctttttttgggagcaactgtcttgctcaatttctaaaagctgacgcgacccgtgtgggagcggccttgcccgcgaagccaacaccgtGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCgg < 1:528110‑M2/33‑1 (MQ=255) actggatgccgtttgctttttttgggagcaactgtcttgctcaatttctaaaagctgacgcgacccgtgtgggagcggccttgcccgcgaagccaacaccgtGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCgg > 2:528110‑M2/103‑135 (MQ=255) gtggtggAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGa > 2:2269552/1‑150 (MQ=255) tggtggAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGAt < 1:1728801/150‑1 (MQ=255) ggtggAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATc < 2:1038695/150‑1 (MQ=255) gtggAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATcg > 1:631311/1‑150 (MQ=255) tggAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATcgc > 2:1724641/1‑150 (MQ=255) ggAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACGACGTACTGGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATcgcg < 2:1230373/150‑1 (MQ=38) ggAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATcgcg > 2:986988/1‑150 (MQ=255) gagaGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCgg > 1:93358/1‑150 (MQ=255) agagTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGt < 1:1121031/150‑1 (MQ=255) gagTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGtt > 1:1065223/1‑150 (MQ=255) tGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCACGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTtgct < 2:315156/150‑1 (MQ=255) gACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTtgctg < 2:1470113/150‑1 (MQ=255) tttttttgggagcaactgtcttgctcaatttctaaaagctggcgcgatccctgggggagcgggcttgcccgcgaagccaacaccgtGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTcgcg > 2:99540‑M2/87‑118 (MQ=255) tttttttgggagcaactgtcttgctcaatttctaaaagctggcgcgatccctgggggagcgggcttgcccgcgaagccaacaccgtGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTcgcg < 1:99540‑M2/32‑1 (MQ=255) ccTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCa > 1:1395440/1‑96 (MQ=255) ccTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCa < 2:1395440/96‑1 (MQ=255) cTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAg > 1:149353/1‑150 (MQ=255) tGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAgg > 1:2013005/1‑150 (MQ=255) gAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGc > 2:2179150/1‑150 (MQ=255) aaGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGtt > 1:1545949/1‑139 (MQ=255) aaGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGtt < 2:1545949/139‑1 (MQ=255) gATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTaa > 1:244513/1‑150 (MQ=255) aTGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACTTGCCCGCGCTGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAAc < 1:1897988/150‑1 (MQ=255) cGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCt < 1:373120/150‑1 (MQ=255) gATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTCAACCCTTTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCtt < 1:776739/150‑1 (MQ=255) gATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCtt < 1:57886/150‑1 (MQ=255) aTTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTc < 1:190949/150‑1 (MQ=255) aTTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTc < 2:1065223/150‑1 (MQ=255) ttGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGCGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCGCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTACCgaataa > 2:1072776/1‑145 (MQ=255) tgtggggCGCAGAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCAt < 2:2247280/147‑1 (MQ=255) gCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATg < 2:961482/150‑1 (MQ=255) ggggCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGtt < 2:617197/126‑1 (MQ=255) ggggCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGtt > 1:617197/1‑126 (MQ=255) gCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCg > 2:517715/1‑150 (MQ=255) tCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACCACGCTGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCt < 1:614820/150‑1 (MQ=38) tCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCt > 2:1800484/1‑150 (MQ=255) aTAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGa > 1:1557018/1‑150 (MQ=255) aTAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGa < 1:319188/150‑1 (MQ=255) aTAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGa > 1:2085295/1‑150 (MQ=255) aGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATa < 1:1987556/150‑1 (MQ=255) aCCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCg < 2:2209486/90‑1 (MQ=255) aCCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCg > 1:2209486/1‑90 (MQ=255) ccAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCGCCGCTGATAGCGCGCATCCAc > 1:572665/1‑150 (MQ=255) cAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCAcc > 2:136777/1‑150 (MQ=255) aaGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCAccc > 2:146560/1‑150 (MQ=255) tGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGGTCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCt > 1:1779524/1‑129 (MQ=255) tGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCt < 2:1779524/129‑1 (MQ=255) gggCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTc < 2:1780442/113‑1 (MQ=255) gggCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGGTGCTGCCAGGCTAACGCTTc > 1:1780442/1‑113 (MQ=255) gCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTc > 2:1709903/1‑131 (MQ=255) gCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTc < 1:1709903/131‑1 (MQ=255) gCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAAc < 1:1891206/150‑1 (MQ=255) aTTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGGTAGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCa > 2:1557767/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCAgg < 1:1800484/150‑1 (MQ=255) cgggcgCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGATTCGCCCATGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCAGGCCGt < 1:2272990/150‑1 (MQ=255) gggcgCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGGTTAATGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCAGGCCGTg < 1:986988/150‑1 (MQ=255) gcTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCtt > 2:1780841/1‑97 (MQ=255) gcTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCtt < 1:1780841/97‑1 (MQ=255) ggACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCAGGCCGTGGTCAGCTTGCg < 1:2325930/150‑1 (MQ=255) gACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAAc > 1:1162312/1‑129 (MQ=255) gACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCAGGCCGTGGTCAGCTTGCgg < 1:1724641/150‑1 (MQ=255) gACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCAGGCCGTGGTCAGCTTGCgg < 2:2013005/150‑1 (MQ=255) gACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCACGGCAAAc < 2:1162312/129‑1 (MQ=255) ccaacaccgtGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCggg < 1:1707004‑M2/34‑1 (MQ=255) ccaacaccgtGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCggg > 2:1707004‑M2/11‑44 (MQ=255) cgcgcgGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTcgc > 2:475115/1‑36 (MQ=33) cgcgcgGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTcgc < 1:475115/36‑1 (MQ=33) | TGAATCGGCAGTGGCCGAGGTGATCAAGGCGGCCGGGGCCAAGCTGGTGGTGGTGGAGAGTGACCCTGAAGATGCGATTGCGGGGCTCATAGCCAGCGTTGACCAAGTGGTTGGGGCATTGGGCGGGCGCTGATCGGACAGGCCCGCGCGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCAAGGATCGCGGTTGCTGCCAGGCTAACGCTTCATGCACCGCTGATAGCGCTCATCCACCCGCCCGGCAAACCAGGCCGTGGTCAGCTTGCGG > NC_002947/4332972‑4333257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |