New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2864030 = | 79 (0.900) | 4 (0.050) | 4/228 | NT | 5.2% | coding (1047/1194 nt) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
? | NC_002947 | 2864064 = | 74 (0.910) | coding (1081/1194 nt) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
GCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTAAAGTAGGCTCAGCGGGT > NC_002947/2863915‑2864212 | gCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcac > 2:2070704/1‑150 (MQ=255) gcCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgcccggcac > 2:1762739/1‑150 (MQ=255) ccGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgcccggcact > 1:1006522/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTAATGGTGCGATCGGGCATGCTGGCGGACGGTG‑CTTCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgcccggcactg > 1:2037332/1‑150 (MQ=255) gtggAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATc < 2:2106346/150‑1 (MQ=255) gAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGTCTTCCAGTTGGCTTACGAGATTGCCATCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGc < 1:1898209/150‑1 (MQ=255) gAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACCGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGc < 2:373440/150‑1 (MQ=255) cgcTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCAt < 2:1862265/150‑1 (MQ=255) gcTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATg > 2:922423/1‑150 (MQ=255) tGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCa > 2:2317196/1‑150 (MQ=255) tGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCa > 1:976851/1‑150 (MQ=255) cGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTg > 2:450559/1‑150 (MQ=255) ggTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTCTATAAGGGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTgg < 1:42021/150‑1 (MQ=255) ttATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGct > 2:352880/1‑150 (MQ=255) aTCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGctgc < 1:1785256/150‑1 (MQ=255) ccGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGctgcct > 2:1317696/1‑150 (MQ=255) tgccgccggtgactgcaggcagccactgcgctgcatgaggccgatggcgcgggcagtgccgggcagTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgcccg > 1:1110243‑M1/67‑107 (MQ=255) tgccgccggtgactgcaggcagccactgcgctgcatgaggccgatggcgcgggcagtgccgggcagTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTggcactgcccg < 2:1110243‑M1/41‑1 (MQ=255) gTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGt < 1:1378296/140‑1 (MQ=255) 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aCATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCgcgc > 1:1811715/1‑150 (MQ=255) aCATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGGGGCTGCCTGCGGTCACCGGCGGCAGTCgcgc > 2:1289768/1‑150 (MQ=255) cATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCt < 1:922423/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGa < 2:1306855/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCGGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTgct < 1:378899/150‑3 (MQ=255) 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CGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCAGGCACTGCCCGCGCCATCGGCATCTTGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCagga > 1:1551982‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGTTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCaggagg > 1:450559‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCaggagg > 1:1075343‑M1/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTg > 1:1826037/1‑150 (MQ=255) aCTGCACCGCCTGCGGCGGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCCTGCAAAGGCAAGCTTGCAGTCATGCACCGGCGGCAGTCACGCTGATGGCCTGTATCTGCCAGGTCATCACCGATCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGc < 1:1695467/150‑1 (MQ=255) aCTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGc < 1:1222845/150‑1 (MQ=255) tGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCt < 2:1459473/150‑1 (MQ=255) gCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTa < 2:1012374/104‑1 (MQ=255) gCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTa > 1:1012374/1‑104 (MQ=255) cAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTa > 2:2213343/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTaa < 1:352880/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGAGCAGTGGCTGACTGCAGTCACCGGCGGCAGTCTCGCAGATGGCCTGTATCCTCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTaa > 2:2016509/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGGGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTaaa < 1:515583/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTaaa < 1:1430525/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTcgc > 2:2269077/1‑84 (MQ=255) ccTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTcgc < 1:2269077/84‑1 (MQ=255) ccgctggcaCTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGt < 1:1391420‑M2/126‑1 (MQ=255) ccgctggcaCTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGt > 2:1391420‑M2/10‑135 (MQ=255) caCTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCCGGACAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTAAAGTACGCTCAGCggg < 1:1289768‑M2/148‑1 (MQ=255) aCTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGTCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTAAAGTAGGCTCAGCGGGt < 2:1686014‑M2/149‑1 (MQ=255) aCTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGAt < 1:174727‑M2/77‑1 (MQ=255) aCTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGAt > 2:174727‑M2/2‑78 (MQ=255) aCTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTAAGCCCAGGAGGGTGCCTTAAAGTAGGCTCAGCGGGt > 1:1342631‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGG‑CGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACGCCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGGGTGCCTTAAAGTAGGCTCAGCGGGT > NC_002947/2863915‑2864212 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |