| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4700790 = | 75 (0.850) | 5 (0.060) | 3/220 | NT | 6.1% | intergenic (‑57/+93) | kdpD/kdpC | sensor protein/potassium‑transporting ATPase subunit C |
| ? | NC_002947 | 4700862 = | 87 (1.110) | intergenic (‑129/+21) | kdpD/kdpC | sensor protein/potassium‑transporting ATPase subunit C | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTCGACCGGCAGCTG > NC_002947/4700714‑4701008 | cgcgGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGc < 2:1262172/150‑1 (MQ=255) ggAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCCACAGTCCGCCGCTTCAGGGGAAGCACCCTTAACGTTTAGGAGCGCGTTTCCCCGCGCATACG‑ATGTACCTGCTACTACAGCATTCGCGTGTGAACCCGCTCCTACCTGCTTCCTGc > 2:652352/1‑150 (MQ=255) gTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAg > 2:103787/1‑150 (MQ=255) aCTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGTTCACGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAgcgc > 1:1193783/1‑150 (MQ=255) aCTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAgcgc > 1:1760201/1‑150 (MQ=255) cTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACATGTACGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTCCCTGCCAGCGCt > 2:1564018/1‑150 (MQ=255) tCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCtt > 2:1712690/1‑150 (MQ=255) tCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCtt > 1:1710613/1‑150 (MQ=255) tCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCtt > 2:2082317/1‑150 (MQ=255) tCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTTAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGATATTGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTAc < 1:1133180/150‑1 (MQ=39) cATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTAcc > 1:678095/1‑150 (MQ=255) ccTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGa < 2:2198564/150‑1 (MQ=255) ccTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGCTTCATGCCAGCGCTTAGAATAACTGa > 2:132100/1‑150 (MQ=38) cTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGAc < 1:1044655/150‑1 (MQ=255) cTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACAACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGAc > 1:25209/1‑150 (MQ=255) tttACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTcc > 1:888693/1‑126 (MQ=255) tttACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTcc < 2:888693/126‑1 (MQ=255) tttACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGa > 2:1730987/1‑148 (MQ=255) tttACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGa < 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aCAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCtttt < 2:1149707/150‑1 (MQ=255) cgccgcTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAgg > 2:528317/1‑150 (MQ=255) gccgcTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGAGGGCTTTTCCAAGGc > 1:481134/1‑150 (MQ=255) gccgcTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGc > 2:203996/1‑150 (MQ=255) cTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTgg < 1:1833015/150‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTgg < 2:1278100/150‑1 (MQ=255) ttCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGt < 1:1535236/150‑1 (MQ=255) aGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATgg > 2:1717772/1‑126 (MQ=255) aGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCa > 1:2062848/1‑150 (MQ=255) gggAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCaa > 1:2101519/1‑150 (MQ=255) aaaGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACACCTGGTAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGc < 1:652352/150‑1 (MQ=37) aaGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGcc > 1:1605817/1‑150 (MQ=255) ccTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTTCTTCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTTGTGCAACGCCCGCaag > 2:489857/1‑148 (MQ=38) cTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCaa > 1:1239694/1‑127 (MQ=255) cTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCaa < 2:1239694/127‑1 (MQ=255) TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGaccac < 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2:1823035/1‑150 (MQ=255) ggCATTCGCGGGTGAAGCCGCGCCTACAGGCTTCCGGCCGGGGCTTCGATTACCGGACAATGGCGAGCTTTTCCGAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCGCCGGGGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAgg < 1:495428/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTg > 2:1404079/1‑150 (MQ=255) tcccgGGTGACCCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGc < 1:1564018/147‑1 (MQ=255) gcgGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGacc > 2:693571/1‑97 (MQ=255) gcgGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGacc < 1:693571/97‑1 (MQ=255) gcgGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCaa < 2:2047612/150‑1 (MQ=255) cgGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAg < 1:132100/150‑1 (MQ=255) tcaacccgctcctacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAATGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCt < 1:103787‑M2/134‑1 (MQ=255) gAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTc < 2:531864/150‑1 (MQ=255) cccgctcctacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGGGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTCGAc > 2:1471325‑M2/13‑150 (MQ=255) ccgctcctacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTCGAcc > 1:1625830‑M2/12‑150 (MQ=255) gctcctacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAg > 2:96683‑M2/10‑111 (MQ=255) gctcctacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTCGACCgg > 2:728294‑M2/10‑150 (MQ=255) tcctacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTCGACCGGCa < 1:1712690‑M2/143‑1 (MQ=255) ctacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTCGACCGGCAGc > 1:1075167‑M2/6‑150 (MQ=255) tacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTg < 1:1152389‑M2/111‑1 (MQ=255) tacaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTg > 2:1152389‑M2/5‑115 (MQ=255) acaGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTCGACCGGCAGCTg > 2:1307137‑M2/4‑150 (MQ=255) caGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGc > 2:1487551‑M2/3‑69 (MQ=255) caGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGc < 1:1487551‑M2/67‑1 (MQ=255) | GCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGC‑ACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGATCAATGGGTGGAGGGTGGCCTGTTCCAGCAAGGCTTGCAAGCGCTCGACCGGCAGCTG > NC_002947/4700714‑4701008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |