New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4793607 = | 105 (1.190) | 6 (0.070) | 6/232 | NT | 5.8% | coding (278/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4793634 = | 95 (1.150) | coding (251/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATCGGCAACAGCGCGAAA > NC_002947/4793486‑4793783 | cgaggttgctgcccgtgacgcgctgtcatatgcccagcagcgcatgtggttcgcctggcggctcgatgccaagagtgctgcctacaacctgcccatggcagtcaagctcaaggggccgatAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATc > 1:476624‑M1/121‑150 (MQ=255) gggAAAGGTCCAACATCTCCCCCCTGATCGATGCCTCCCAAGGCACGCGTTGTCGTCGCTGGTCGTCAACCTGGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCg < 1:1778575/150‑1 (MQ=255) gAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTAGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACTAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGc > 1:887365/1‑150 (MQ=255) aaaGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGcc > 1:1468777/1‑150 (MQ=255) gTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCtt > 2:2001076/1‑150 (MQ=255) tgcccgtgacgcgctgtcatatgcccagcagcgcatgtggttcgcctggcggctcgatgccaagagtgctgcctacaacctgcccatggcagtcaagctcaaggggccgatagcgcctgctgcaaggcctcaggcgctATCGGCCCCTTg < 2:431023‑M2/12‑1 (MQ=255) tCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCTACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGc < 2:849310/144‑1 (MQ=255) tCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCTACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGc > 1:849310/1‑144 (MQ=255) tCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATc < 1:814568/141‑1 (MQ=255) ccAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGa < 1:641000/150‑1 (MQ=255) cAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATc < 1:1802419/139‑1 (MQ=255) cAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATc > 2:1802419/1‑139 (MQ=255) cAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAg > 1:263907/1‑150 (MQ=255) 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ggTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAAc < 1:1303223/150‑1 (MQ=255) tgtCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCt < 2:2035643/150‑1 (MQ=255) tgtCCAGCGCCTGCTGCAAGGACTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCCGCAACCt < 2:1203154/150‑1 (MQ=255) gatagcgcctgaggccttgcagcaggcgctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCg > 1:476624‑M2/31‑150 (MQ=255) ccAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGa > 1:1601529/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGa > 2:314602/1‑150 (MQ=255) tagcgcctgaggccttgcagcaggcgctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGaa > 1:312559‑M2/29‑99 (MQ=255) tagcgcctgaggccttgcagcaggcgctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGaa < 2:312559‑M2/71‑1 (MQ=255) CCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAg > 2:736563‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAgg < 1:759167‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGgc < 2:730088‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCTGCAAGGCCGCAGGGGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGTCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCCCTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGCACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGgc > 2:181336‑M1/1‑150 (MQ=255) gccttgcagcaggcgctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGgcagc < 1:1952239‑M2/113‑1 (MQ=255) cAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATgcg < 1:1155815/96‑1 (MQ=255) cAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATgcg > 2:1155815/1‑96 (MQ=255) cAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGAt < 1:1179446/150‑1 (MQ=255) aaGGCCTCAGGCGCGATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTCTCGGCCATCCTCTAGGGAGCATTGCATCAGCCTTGCCGGATGCGCTGCTGTGGTTATGACTTCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATc < 2:263907/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGAt < 1:703597/143‑1 (MQ=255) gcgctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACgg < 1:758757‑M2/108‑1 (MQ=255) gcgctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACgg > 2:758757‑M2/6‑113 (MQ=255) cgctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATCGGCAACAgcgc < 2:2204965‑M2/146‑1 (MQ=255) cgctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATCGGCAACAgcgc < 1:1950740‑M2/146‑1 (MQ=255) ctATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATCGGCAACAGCGCGa > 1:1713079‑M2/3‑150 (MQ=255) tATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATCGGCAACAGCGCGaa < 2:476624‑M2/149‑1 (MQ=255) tATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATCGGCAACAGCGCGaa > 2:764059‑M2/2‑150 (MQ=255) aTCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATCGGCAACAGCGCGaaa < 1:431023/150‑1 (MQ=255) | GTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGACCCCAGGCGCGATCGGCAACAGCGCGAAA > NC_002947/4793486‑4793783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |