| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6146542 = | 96 (1.090) | 11 (0.130) | 9/246 | NT | 11.1% | coding (865/1023 nt) | PP_5392 | WD40/YVTN repeat‑containing protein |
| ? | NC_002947 | 6146577 = | 81 (0.930) | coding (830/1023 nt) | PP_5392 | WD40/YVTN repeat‑containing protein | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ACCTTATGGGTAGCAACGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGCCGATCACCTTGC > NC_002947/6146433‑6146724 | aCCTTATGGGTAGCAACGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGCCAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTa < 1:2007895/150‑1 (MQ=255) gggTAGCAACGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCt < 2:1556688/150‑1 (MQ=255) ggctAGCAACGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGAGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCt > 1:2336686/4‑150 (MQ=255) gatggccaccgttgacggtcgccaggtctatgtcgcgaaccagggcagcggccagaatccggacgaccgagtctccatcgtagatatccagacgcgtagcagCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGgct > 2:886078‑M1/103‑139 (MQ=255) gatggccaccgttgacggtcgccaggtctatgtcgcgaaccagggcagcggccagaatccggacgaccgagtctccatcgtagatatccagacgcgtagcagCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGgct < 1:886078‑M1/37‑1 (MQ=255) gTAGCAACGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTg < 2:1771485/149‑1 (MQ=255) gTAGCAACGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTg > 1:1771485/1‑149 (MQ=255) aaCGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATc > 2:193589/1‑150 (MQ=255) aCGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTa < 1:152926/135‑1 (MQ=255) aCGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTa > 2:152926/1‑135 (MQ=255) gACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTAc > 1:1434402/1‑150 (MQ=255) gacggtcgccaggtctatgtcgcgaaccagggcagcggccagaatccggacgaccgagtctccatcgtagatatccagacgcgtagcagCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGgc < 1:1369928‑M1/36‑1 (MQ=255) gacggtcgccaggtctatgtcgcgaaccagggcagcggccagaatccggacgaccgagtctccatcgtagatatccagacgcgtagcagCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGgc > 2:1369928‑M1/90‑125 (MQ=255) cTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGAt > 1:161002/1‑150 (MQ=255) ttACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATg > 1:132048/1‑150 (MQ=255) ttACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTAATAGCCCGCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCATGGCGCTGCGCGTGGTGATATCTACGATg > 1:987834/1‑150 (MQ=255) tACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATgg < 1:55843/150‑1 (MQ=255) aCGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGga < 1:738280/150‑1 (MQ=255) aCGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGga < 1:193589/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCt > 1:995066/1‑140 (MQ=255) 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tCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCt > 2:1120143/1‑126 (MQ=255) tCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCt < 1:1120143/126‑1 (MQ=255) tATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGgtcgt > 1:1748229/1‑150 (MQ=255) aGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTg > 1:442221/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGccc > 2:1761664/1‑150 (MQ=255) cTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGgctgc > 2:1246612/1‑93 (MQ=255) 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aaCACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAAACTCGGTCGTCCGGATTCTGGACGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTgg < 2:683824/150‑1 (MQ=255) acacATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGc < 2:1259279/150‑1 (MQ=255) cacaTAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCg > 2:404673/1‑150 (MQ=255) aTAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGgtcgtc < 1:421211/105‑1 (MQ=255) aTAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGgtcgtc > 2:421211/1‑105 (MQ=255) tAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTgg < 1:391142/126‑1 (MQ=255) 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ccATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGc < 1:1102644/150‑1 (MQ=255) CATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCg < 1:1998449‑M1/150‑1 (MQ=255) ctgggcaccgtgaccaccggcaagggtgcccaggCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTgg < 1:421843‑M2/97‑1 (MQ=255) ctgggcaccgtgaccaccggcaagggtgcccaggCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTgg > 2:421843‑M2/35‑131 (MQ=255) ctgggcaccgtgaccaccggcaagggtgcccaggCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGt > 1:1398408‑M2/35‑150 (MQ=255) ggCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCg > 1:365634/1‑150 (MQ=255) gCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCTCGACATAGAc < 2:1737869/107‑1 (MQ=255) gCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGAc > 1:1737869/1‑107 (MQ=255) caccgtgaccaccggcaagggtgcccaggCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCt < 1:811725‑M2/79‑1 (MQ=255) caccgtgaccaccggcaagggtgcccaggCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCt > 2:811725‑M2/30‑108 (MQ=255) ttGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGt < 2:2304253/119‑1 (MQ=255) tggtCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCt > 2:1174364/1‑150 (MQ=255) tCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGc < 1:1174364/150‑1 (MQ=255) tCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGATTCGTGTCATAGACATGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGc > 1:1210322/1‑150 (MQ=255) cACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGcc < 1:640602/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGCCGa < 1:1883978/150‑1 (MQ=255) cccAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGcctgtcagc > 2:167143/1‑143 (MQ=255) cccAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGCCGATCAcc > 2:1175773/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGa < 1:1961219/128‑1 (MQ=255) cAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGa > 2:1961219/1‑128 (MQ=255) cAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGCCGATCACCtt < 2:543944/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGCCGATCACCTTGc < 1:1238320/150‑1 (MQ=255) | ACCTTATGGGTAGCAACGACCTTACGGCTGCTCGTATCGATGACAGATACGGTGCCTGCTTCAATATTGCTGACAAACACATAAGCGCCGTCGCTGCTGATGGCCACACCATGGGCACCCTTGCCGGTGGTCACGGTGCCCAGGCTGCTACGCGTCTGGATATCTACGATGGAGACTCGGTCGTCCGGATTCTGGCCGCTGCCCTGGTTCGCGACATAGACCTGGCGACCGTCAACGGTGGCCATCATCTGGATTGGCGTGCGGCCGACATCAACCTTGCCGATCACCTTGC > NC_002947/6146433‑6146724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |