New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1015841 = | 39 (0.090) | 471 (1.040) | 179/286 | 0.3 | 92.3% | intergenic (‑68/‑700) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
? | NC_002947 | 4541196 = | NA (NA) | intergenic (+730/‑85) | PP_4022/PP_4024 | hypothetical protein/transposase |
Only 100 of 471 total aligned reads displayed.
CGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1015989‑1015841 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTCGAA > NC_002947/4541196‑4541344 CGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCG > 1:6343047/1‑150 CGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCG < 1:9965036/150‑1 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2:1995162/1‑150 GCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCA > 2:6831235/1‑150 GCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCA < 1:7290492/150‑1 GCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCA < 1:4917776/150‑1 AGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACA < 1:6831235/150‑1 GCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATT > 2:2207789/1‑150 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ATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGAT > 2:9195930/1‑150 ATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGAT > 1:3873196/1‑150 AAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCT < 1:8701624/150‑1 AAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCT > 2:3815188/1‑150 AAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTG > 1:1859771/1‑150 AAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGT < 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TAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTT < 1:3044051/150‑1 AACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCT < 1:1108269/150‑1 ACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTG < 1:7521616/150‑1 CCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGA < 1:2650592/150‑1 CCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGA > 1:9152497/1‑150 TTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCC < 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> 1:8032973/1‑106 CACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCC < 2:8032404/106‑1 ACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGAT > 1:3342397/1‑150 CTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATG > 2:740549/1‑150 CTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATG > 1:10291079/1‑150 TTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGC < 2:9122635/150‑1 ATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCAATAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCC > 1:624818/1‑150 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CTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGT < 2:35704/150‑1 TAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTG > 1:9362970/1‑150 TAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTG > 1:9425215/1‑150 TAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTG > 2:4325281/1‑150 TAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTG < 1:5399164/150‑1 TAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTT > 1:2306542/1‑79 AATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGG < 2:6253927/150‑1 ATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGA < 1:2150922/150‑1 TTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACT > 2:8607737/1‑150 TTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTC < 1:2775631/150‑1 TTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTC < 1:4064776/150‑1 CCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTCGA < 2:6528790/150‑1 CGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTCGAA < 1:3303303/150‑1 CGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTCGAA > 1:10016280/1‑150 CGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTG < 2:1734619/140‑1 CGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1015989‑1015841 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTCGAA > NC_002947/4541196‑4541344 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |