New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1143486 = | 563 (1.500) | 50 (0.150) | 13/248 | NT | 9.6% | intergenic (‑62/+103) | arcC/arcB | carbamate kinase/ornithine carbamoyltransferase |
? | NC_002947 | 1143575 = | 436 (1.290) | intergenic (‑151/+14) | arcC/arcB | carbamate kinase/ornithine carbamoyltransferase |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GCGGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1143648‑1143486 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgctcccacag‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTA > NC_002947/1143575‑1143723 GCGGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATG > 2:2635058/1‑150 GCGGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATG > 2:3944653/1‑150 CGGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGC < 1:8649652/150‑1 CGGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGC < 1:1500444/150‑1 CGGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGC > 2:6714984/1‑150 GGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCC < 1:5727721/150‑1 GGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCC > 2:570917/1‑150 GGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCC < 2:5792480/150‑1 GGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCC > 2:6638983/1‑150 AAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGC < 1:5907732/150‑1 AACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCT < 1:2388153/150‑1 AACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCT < 1:1717119/150‑1 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> 1:2568354/1‑150 CACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCAGTTGGCCAGGTCCG > 1:6380536/1‑150 CACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCAAGCGGTTTTACGCCTGCTCGAAGGCGATGAACGCTGGCGAAACGAACACGACATCGGTCACTTAGATGACGTTGGCCAGGTACG > 2:2495773/1‑150 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG > 1:3126795/1‑150 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG > 1:526620/1‑150 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG > 1:5533967/1‑150 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG < 1:5655534/150‑1 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG > 1:5254923/1‑150 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG > 1:1836974/1‑150 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG < 2:6669307/150‑1 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG < 1:2516446/150‑1 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG > 2:5503041/1‑150 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG > 1:2578167/1‑150 ACAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGG < 2:294041/150‑1 CAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGG < 2:6255332/150‑1 CAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGG < 1:8520579/150‑1 CAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGG > 1:5064677/1‑150 CAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGG < 1:659952/150‑1 CAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGG < 2:1415764/150‑1 CAG‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGG < 2:2165515/150‑1 G‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTA < 2:6958089/150‑1 G‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTA > 2:4742963/1‑150 G‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTA > 2:4742951/1‑150 GCGGAAAACCGCATGCACACGATCAAGGCGATCCTGGTATCGACCCTGGCTGATCTATAAGTAGCCCGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGCGTCAGCCGCATCATCGATGATGTCAGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1143648‑1143486 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgctcccacag‑GGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTA > NC_002947/1143575‑1143723 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |