New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1143486 = | 563 (1.500) | 50 (0.150) | 13/248 | NT | 9.6% | intergenic (‑62/+103) | arcC/arcB | carbamate kinase/ornithine carbamoyltransferase |
? | NC_002947 | 1143575 = | 436 (1.290) | intergenic (‑151/+14) | arcC/arcB | carbamate kinase/ornithine carbamoyltransferase |
Only 100 of 665 total aligned reads displayed.
TGGAATGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTAT > NC_002947/1143426‑1143724 | tgGAATGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGTCCGCTCCCACAgg < 2:2129826/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTg > 2:1222924/1‑150 (MQ=255) ccTTTAGCGAAAGATTGAATGGACTGTCGCTGCACGTATGCTGCTGAGTTCGGTGTGGGAGCGGGCATGCCGGCTAAGAGGCCAGACCTGACATCATCTATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGAACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCgg < 2:3330353/150‑1 (MQ=255) cTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCAACGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACACGGCCTGCggg > 1:6669307/1‑150 (MQ=255) tttAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGc > 2:7618971/1‑150 (MQ=255) tAGCGAAATAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTa < 2:1337658/150‑1 (MQ=255) gctaaaGAATGAAGGGTCTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGTGTTCGCTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGACGAGGCCAGACCTGACATCACCGAGGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACt < 1:5985838/147‑1 (MQ=255) cGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACtt > 1:2011988/1‑150 (MQ=255) cGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCAACGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGACTGCGGGCTACtt > 1:2407311/1‑150 (MQ=255) gAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTta > 2:3191896/1‑150 (MQ=255) gAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTta > 2:1767284/1‑150 (MQ=255) gAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTta > 1:546129/1‑150 (MQ=255) aaGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTtata < 2:3096765/150‑1 (MQ=255) gaatgaatGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGa > 1:469328/1‑150 (MQ=255) gaatgaatGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCATCGCGGGCACGCCCGCTCCCACACGGCCGGCGGGCGACGTATAGa > 1:2166323/1‑150 (MQ=255) tgattgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTGGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGTTGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCa < 1:6962627/150‑1 (MQ=255) tgaatgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCa > 2:4935614/1‑150 (MQ=255) tGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTc > 2:5158695/1‑150 (MQ=255) 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ccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACt > 2:1559441/1‑150 (MQ=255) cttcgcgggcatgcccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTgg > 2:577273‑M2/27‑124 (MQ=255) cTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACtt > 1:1105908/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGa > 1:5112187/1‑60 (MQ=255) gagcgggcgtgcccgctcccacagGGACAGCGGGCTACTTATAGATCACCCAGGCTCGATACCACGATCCCCTTGAACGTGTGCATGCGGTTTTACGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACCTCATCGGTCACTTCg > 2:2352816‑M2/25‑150 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGc > 2:2656736/1‑150 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCg < 2:4532446/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGtt > 2:5445260/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGtt > 2:1459517/1‑150 (MQ=255) gcccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTgg > 2:3824937‑M2/15‑150 (MQ=255) cccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGc < 2:602128‑M2/137‑1 (MQ=255) ccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGcc > 1:1001525‑M2/13‑150 (MQ=255) cgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCa > 1:7109469‑M2/12‑150 (MQ=255) gctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAg < 1:5259171‑M2/140‑1 (MQ=255) ccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTcc > 1:3918743‑M2/7‑150 (MQ=255) ccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTcc > 1:1596032‑M2/7‑150 (MQ=255) cacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCg > 1:2568354‑M2/6‑150 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg > 1:5533967‑M2/5‑150 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg < 1:5655534‑M2/146‑1 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg < 2:8170015‑M2/146‑1 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg > 2:2898830‑M2/5‑150 (MQ=255) gGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTa < 2:6958089‑M2/149‑1 (MQ=255) | TGGAATGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTAT > NC_002947/1143426‑1143724 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |