New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 967867 | 450 (1.200) | 29 (0.090) | 15/246 | NT | 6.0% | intergenic (‑43/+125) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 967928 | 502 (1.500) | intergenic (‑104/+64) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
Only 100 of 731 total aligned reads displayed.
GGGTAGGTGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACG > NC_002947/967718‑968016 | gggTAGGTGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGT < 1:5684030‑M1/150‑1 (MQ=255) gggTAGGTGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGT < 2:6607087‑M1/150‑1 (MQ=255) aGGTGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAAc > 1:8727542/1‑150 (MQ=255) ggTGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAAcc < 1:1268222/150‑1 (MQ=255) ggTGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAAcc < 1:4207264/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGc < 1:7586503/150‑1 (MQ=255) cTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGccc < 2:7070717/150‑1 (MQ=255) tttGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGcccc > 2:4791133/1‑150 (MQ=255) tttGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGcccc > 1:2656839/1‑150 (MQ=255) cctgctggcgcacaaggccaagcccaaggcaccggctgcggtcaaaggctacgtggcggtggccgccaaaccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTTTACccgcgaa > 2:4356789‑M1/125‑147 (MQ=255) tgctggcgcacaaggccaagcccaaggcaccggctgcggtcaaaggctacgtggcggtggccgccaaaccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTTTacccgcgaaga > 1:6030819‑M1/123‑145 (MQ=255) tGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTtcacccgcgaaga < 2:3252259‑M1/150‑14 (MQ=255) tGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCca < 1:2030929/150‑1 (MQ=255) cgggAACATGTACAACACATCGTCCCGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGCATGTCTTCAGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTAGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCcac > 2:1569215/2‑150 (MQ=255) gggAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATTACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGACAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCcagt < 2:7225250/150‑3 (MQ=255) gggAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCcaca > 2:1208386/1‑150 (MQ=255) gggAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCcaca < 2:7920811/150‑1 (MQ=255) ggAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAg < 1:3285470/150‑1 (MQ=255) ggAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAg < 1:4794297/150‑1 (MQ=255) aCATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTa < 2:6484684/150‑1 (MQ=255) aTGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACt < 2:3064285/150‑1 (MQ=255) tGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTg > 1:1434788/1‑150 (MQ=255) gTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGc > 2:3782948/1‑150 (MQ=255) 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cGTCCGGGCGCGGCGGGACGCTGCCGAGAACGGGGATGTCCTCGGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTGGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCac < 2:8085400/150‑2 (MQ=255) tCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCaaaa > 1:2231365/1‑149 (MQ=255) gggCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCt > 2:3718822/1‑150 (MQ=255) gggCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCt < 2:5357613/150‑1 (MQ=255) ctctGCGGGAAGCTGCAGATACCGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCtgtg < 2:2904922/150‑1 (MQ=255) ccggctgcggtcaaaggctacgtggcggtggccgccaaaccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCtgtg > 2:8737102‑M1/94‑150 (MQ=255) ccggctgcggtcaaaggctacgtggcggtggccgccaaaccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCtgtg > 2:4083514‑M1/94‑150 (MQ=255) tctGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGc > 1:5385013/1‑150 (MQ=255) tctGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGc > 1:683424/1‑150 (MQ=255) ctGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagta < 1:1609565‑M1/150‑45 (MQ=255) 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tAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttc < 1:919645‑M1/150‑62 (MQ=255) ggggATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTaccc > 1:5903511‑M2/1‑146 (MQ=255) ggggATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTaccc > 2:7438940‑M2/1‑146 (MQ=255) ggcggtggccgccaaaccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTAccc > 1:359562‑M1/71‑150 (MQ=255) ggcggtggccgccaaaccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTAccc > 1:2455592‑M1/71‑150 (MQ=255) 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ggCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAAGCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccatc < 2:4931691/150‑1 (MQ=255) gTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAaca > 2:5225600/1‑150 (MQ=255) ttCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACcgc > 1:8043284/1‑150 (MQ=255) tctcGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACcgcg > 2:5853119/1‑150 (MQ=255) ctcGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACACGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCgcgc < 1:3728272/150‑1 (MQ=255) 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catcttcGCGGGTaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaa < 1:6619640‑M1/148‑138 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACACGGCTCAAATCCGGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTggcg > 1:6231678‑M1/1‑150 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTggcg > 1:4095773‑M1/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaag > 1:394797‑M1/1‑12 (MQ=255) cctgtagcgggtttacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaag > 2:8570037‑M1/7‑12 (MQ=255) TCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTggcggc < 2:5597741‑M1/150‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGTaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaagac < 2:4514830‑M1/150‑141 (MQ=255) ttCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaagaca < 1:558129‑M2/150‑81 (MQ=255) TTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCa < 2:6697499‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgGGTaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaagacatcc > 1:6404880‑M1/1‑6 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCg > 1:4491534‑M1/1‑150 (MQ=255) gggTaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgttcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaagacatcccc > 2:1325509‑M1/1‑4 (MQ=255) GGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGcc < 2:1525633‑M1/150‑1 (MQ=255) ggTaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaagacatccccg < 1:4696069‑M1/150‑148 (MQ=255) GGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCa < 1:7885172‑M1/150‑1 (MQ=255) taaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaagacatccccgtt > 2:6762158‑M1/1‑1 (MQ=255) tGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTacccgcgaagaggccctgccagccaacgcgagaaggacctgccatgcacctgacccaccgccccatccggccagaagacatccccgtt < 1:27780‑M2/150‑89 (MQ=255) | GGGTAGGTGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACG > NC_002947/967718‑968016 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |