New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 967867 | 450 (1.200) | 29 (0.090) | 15/246 | NT | 6.0% | intergenic (‑43/+125) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 967928 | 502 (1.500) | intergenic (‑104/+64) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
Only 100 of 717 total aligned reads displayed.
TAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGC > NC_002947/967779‑968077 | aCGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTac < 1:5731315‑M2/150‑3 (MQ=255) tggcggtggccgccaaaccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTAcc > 1:2285249‑M1/72‑150 (MQ=255) gggATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccg > 2:334775‑M2/1‑145 (MQ=255) ggATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccgc < 2:7211320‑M2/150‑7 (MQ=255) tGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccgcgaa > 2:4195374‑M2/1‑141 (MQ=255) cttctGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccgcgaagag < 1:4843233‑M2/150‑13 (MQ=255) cttctGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccgcgaagag > 1:5083670‑M2/1‑138 (MQ=255) ccgccaacccgtgaatcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAagag > 1:6397865‑M1/63‑150 (MQ=255) ttctGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccgcgaagatg < 1:6619640‑M2/150‑14 (MQ=255) ttctGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccgcgaagagg < 2:4716768‑M2/150‑14 (MQ=255) ttctGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccgcgaagagg < 2:3960320‑M2/150‑14 (MQ=255) ttctGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTacccgcgaagagg < 1:4106640‑M2/150‑14 (MQ=255) tctGGCGGGTTGGGGCGGTGGGTCAGGTGCTTGGCTGGTCCTTCTGGGGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTGGCGGGTGAACCCGCCCCAACAGGTACTGCACATGGCTAAAATCCTGTGCTGGCCCTTTAG‑‑‑CGGTTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:5463648/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa > 1:8397845/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa > 2:7552310/1‑150 (MQ=255) ccGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCa > 2:4872716/1‑150 (MQ=255) cGGATGTGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGAACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAg > 2:2780695/1‑150 (MQ=255) ggctGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGGCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGc < 1:7202526/147‑1 (MQ=255) ggATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACTCGCGAAGAGGCCATCAGc < 1:6322340/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCt > 1:3548362/1‑150 (MQ=255) gggCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTcac < 2:7821299/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTcaca > 2:827287/1‑150 (MQ=255) cGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCAcatc > 2:3535077/1‑150 (MQ=255) 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ggGCGGGTTCACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCAc < 1:6479153‑M1/148‑1 (MQ=255) GCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCg < 2:1528128‑M1/150‑1 (MQ=255) gGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTAAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGc > 1:1866813‑M1/2‑150 (MQ=255) aaCCCGCCCCCACAGGTACTGCACCAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTa < 2:5591172/150‑1 (MQ=255) cccGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAG‑‑‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGTGGCCGCCaaaccgt < 1:7522103/150‑7 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |