New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5518239 = | 153 (0.410) | 15 (0.050) | 8/224 | NT | 10.2% | intergenic (+20/‑134) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 5518347 = | 139 (0.460) | intergenic (+128/‑26) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
TGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACA > NC_002947/5518090‑5518388 | ggtcttgcccacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtg > 1:3704255‑M1/150‑150 (MQ=255) gtcttgcccacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtgc > 2:7748752‑M1/149‑150 (MQ=255) gACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGC > 1:4123616‑M1/1‑150 (MQ=255) 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tgcccacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtgcctgt > 1:5976621‑M1/145‑150 (MQ=255) gCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCC > 1:6362775‑M1/1‑150 (MQ=255) cacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCg < 1:5847596‑M1/10‑1 (MQ=255) cTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCG < 1:1332547‑M1/150‑1 (MQ=255) cgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGc > 2:1005230‑M1/139‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |