| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4588466 | 233 (0.620) | 18 (0.050) | 16/276 | NT | 8.3% | intergenic (‑46/+125) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 4588569 | 163 (0.430) | intergenic (‑149/+22) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase | |||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCGGCG > NC_002947/4588420‑4588717 | tgtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑gggggg > 2:8451046/1‑150 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCGAC‑GGGGGGGGGGGcac > 1:3032552/1‑150 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGcac > 1:7465779/1‑150 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGcac > 2:4476956/1‑150 (MQ=255) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCGTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGAGAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGcgccg > 1:8160967/1‑146 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACGCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAA‑GGGGGGGGGGGCACAGt > 1:6819602/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCCCAGt > 2:2617081/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACAGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGt > 2:5229486/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATACCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGAAACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTAAGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑CGGTGGGGGGGCACAGt > 1:7029863/1‑150 (MQ=255) catgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCTGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGTCGGAAACt > 2:172919/1‑150 (MQ=38) catgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCtt > 1:3396367/1‑150 (MQ=255) atgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCAACGGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCtt > 1:8280043/1‑150 (MQ=255) acaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTTTTAAc > 1:6518435/1‑150 (MQ=255) tCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCtt > 1:2444351/1‑150 (MQ=255) ccGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCGGAACCTTGTTAACGGGCttt > 1:4640890/1‑150 (MQ=255) gAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCCCAGGCTGAACCTTGTTAACGGGCtttt > 1:3575290/1‑150 (MQ=255) gAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGTCTGGACCGTGTTAACGGGCtttt > 1:8012405/1‑150 (MQ=255) aGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTc > 1:5368352/1‑150 (MQ=255) 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gcgGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGGCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCCCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCCGGGCTCAATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTtcatc > 2:6735242/1‑150 (MQ=255) cgGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTtcatc < 1:4336597/150‑1 (MQ=255) cgGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTtcatca > 1:8546550/1‑150 (MQ=255) aTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGt > 2:5676048/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATAAGGTCtt > 1:6361909/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGTATTAACCTTTTTAAAGGGCTTTTTAGATGCCCCAGAAGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCGATATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTAATCAGGTCtt > 1:6362229/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTAC‑GGGGGGtcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggcagccttcatcgacgacccgctgtggtacaaggacgccgtcatctaccagctgcacatcaagtcg < 2:1328129‑M2/150‑134 (MQ=255) cccGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCa > 2:1254956/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCa > 2:8269574/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCa > 1:1097324/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAc < 1:4905147/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAcc > 1:2729818/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAcc > 1:1333900/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGTCAGAACCTTGTTAAAGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCCAACGGCAGGTGCCAGGGCTAAATGCGCATCCAATGGGTCTTGCCGTACCACCACCAGCCGTGGCCCTTCAACAGGTATTCAc > 1:7372305/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAcc > 2:3572500/1‑150 (MQ=255) ccccc‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTgg < 2:1560428/146‑1 (MQ=255) accaacggggggggggCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTgg < 2:7381885/144‑1 (MQ=255) aC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGtt > 2:5746373/1‑150 (MQ=255) aC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGtt > 2:4802334/1‑150 (MQ=255) gggggggggggCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGAACAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTc > 2:2203585/1‑150 (MQ=255) ggggggggggCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCg > 2:526036/1‑150 (MQ=255) ggggggggCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCTCCCTGGGTTTCGGc > 2:5781379/1‑150 (MQ=255) | TGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGT‑‑‑‑‑TCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCGGCG > NC_002947/4588420‑4588717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |