Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_002947 | 1,515,811 | (33-bp)2→1 | pseudogene (715‑747/1851 nt) | PP_1325 ← | putative lipoprotein |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_002947 | 1515769 | 1515801 | 33 | 32 [0] | [0] 32 | PP_1325 | putative lipoprotein |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1515802 = | 0 (0.000) | 23 (2.150) | 12/180 | 0.1 | 100% | pseudogene (756/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
? | NC_002947 | = 1515768 | 0 (0.000) | pseudogene (790/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
CCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAG > NC_002947/1515654‑1515895 | ccGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGGCTTGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggc > 1:52135‑M2/1‑115 (MQ=255) ccGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggc > 1:89812‑M2/1‑115 (MQ=255) ccGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggc > 1:243421‑M2/1‑115 (MQ=255) ccGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctgg < 2:43735‑M2/135‑21 (MQ=255) ccGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctgg > 1:43735‑M2/1‑115 (MQ=255) gcgcTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGTGCCTTCCTCAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctcgccagctc < 1:399478‑M2/136‑28 (MQ=255) gcgcTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctc < 1:134424‑M2/136‑28 (MQ=255) gctggctgGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctcct < 1:183265‑M2/136‑30 (MQ=255) gctggctgGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctcct < 1:8378‑M2/136‑30 (MQ=255) ggcCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcg < 1:155239‑M2/136‑65 (MQ=255) ggcCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcg < 1:296696‑M2/136‑65 (MQ=255) ggcCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttcagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcg < 1:166474‑M2/136‑65 (MQ=255) ccATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggc > 2:206463‑M2/1‑70 (MQ=255) cATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggca > 2:239415‑M2/1‑69 (MQ=255) cgcCATCGCGCTGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtg > 1:299763‑M2/2‑64 (MQ=255) aGCCATCGCTCAGTGCGCTTGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCATCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcatttgctggtcggcagggtg > 2:399478‑M2/1‑64 (MQ=255) aGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtg > 2:134424‑M2/1‑64 (MQ=255) cgcgCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgg > 1:298539‑M2/1‑58 (MQ=255) cgcgCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggcgggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgg > 2:344463‑M2/1‑58 (MQ=255) gcgcAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccggg < 2:75562‑M2/136‑80 (MQ=255) gcgcGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtt < 1:299119‑M2/136‑87 (MQ=255) cAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatg < 2:251777‑M2/136‑104 (MQ=255) aGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgatgtttgacccaggcttcgatgg < 2:11310‑M2/136‑105 (MQ=255) aGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagctgggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatgg < 2:44511‑M2/136‑105 (MQ=255) cTTCGAGAGGCAGCAGCAGGTCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggcctgcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg > 1:206152‑M2/1‑25 (MQ=255) cTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg > 1:173172‑M2/1‑25 (MQ=255) cTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg > 2:197542‑M2/1‑25 (MQ=255) cTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg > 1:202299‑M2/1‑25 (MQ=255) cTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg > 1:57115‑M2/1‑25 (MQ=255) gcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctcctagagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggt < 1:210093‑M2/136‑127 (MQ=255) cagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtg < 2:24312‑M2/136‑128 (MQ=255) cagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtg < 1:393260‑M2/136‑128 (MQ=255) | CCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAG > NC_002947/1515654‑1515895 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |