| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2062792 = | 107 (0.370) | 13 (0.050) | 9/226 | NT | 10.6% | intergenic (+16/+112) | PP_1832/PP_1833 | oxidase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2062880 = | 132 (0.550) | intergenic (+104/+24) | PP_1832/PP_1833 | oxidase/hypothetical protein | |||||
ATTGCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2062964‑2062792‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtaggagcgggttcacccgcgaagAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGTTCGGC > NC_002947/2062880‑2063026 ATTGCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATG < 1:4913840/150‑1ATTGCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATG > 2:232009/1‑150 TTGCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCCCGCCTACGACCCACGGTTGCGCCGCCCGGAGGCCACGCGCAGGCAATGT > 1:718100/1‑150 TGCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTA < 1:6816951/150‑1 GCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAG < 1:5134387/150‑1 GCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAG < 1:4483807/150‑1 GCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAG < 2:4417559/150‑1 GCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAG < 2:2203444/150‑1 GCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAG < 1:2652811/150‑1 GCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAG < 1:1435168/150‑1 CGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCACTGTAGGA > 2:6467577/1‑150 CGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAAGGTAGGA > 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ATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAGGAGCGGG < 1:1155390/150‑1 TCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAGGAGCGGGTTC < 1:5628155/150‑1 TCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCAGCGCGCAGTCAATGTAGGAGCGGGTTC > 2:387347/1‑150 CGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAGGAGCGGGTTCA < 2:5113750/150‑1 GATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCGTAGGCATCGCGCCGTCAATGTAGGAGCGGGTTCAC > 2:4031956/1‑150 TGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAGGAGCGGGTTCACCC > 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1:665893/1‑150 CCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGT > 1:950731/1‑150 CCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGT > 2:4855828/1‑150 CGCGAAGCGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGTT < 2:271706/150‑1 CGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGTTCG < 1:3485385/150‑1 CGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGTTCG < 1:3317989/150‑1 AAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGTTCGGC > 1:5620139/1‑150 AAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGTTCGGC > 1:6668322/1‑150 ATTGCCGGTCATCTCGATGCTGCAGAGCCAGCAGCGGTTTGCCTTGCCGACCTACCGCTGAGGGGTGTATTGCCTGAACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACCGACGGTTGCGCCGCCCTTAGGCATCGCGCAGTCAATGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2062964‑2062792‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtaggagcgggttcacccgcgaagAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCTGCAGCATCGAGATGACCGGCAATTCACTGGCCTCTTCGGCCAGGTCACGACGGATGGCACTGATCGCCCAGGACAGCTGTTCGGC > NC_002947/2062880‑2063026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |