| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2062792 = | 107 (0.370) | 13 (0.050) | 9/226 | NT | 10.6% | intergenic (+16/+112) | PP_1832/PP_1833 | oxidase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2062880 = | 132 (0.550) | intergenic (+104/+24) | PP_1832/PP_1833 | oxidase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
GCGGCGCTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCT > NC_002947/2062644‑2062941 | gcggcgCTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCT > 2:6125424‑M1/1‑150 (MQ=255) gccgaacagctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCtt > 1:5620139‑M1/148‑150 (MQ=255) ggcgCTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTC < 1:2703578‑M1/150‑1 (MQ=255) cgaacagctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTcg < 1:3485385‑M1/5‑1 (MQ=255) cgcTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC < 2:656711‑M1/150‑1 (MQ=255) cgcTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC < 1:4479081‑M1/150‑1 (MQ=255) gcTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑G > 2:6401263‑M1/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTGATTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GG < 1:5504555‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTGAGTTGGGTGCTACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCGTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTGCCGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GG < 2:5226006‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GG < 1:1059203‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GG > 2:3449802‑M1/1‑150 (MQ=255) acagctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑gg > 1:950731‑M1/143‑150 (MQ=255) acagctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑gg > 1:665893‑M1/143‑150 (MQ=255) acagctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑gg > 2:3499048‑M1/143‑150 (MQ=255) acagctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑gg > 2:3498752‑M1/143‑150 (MQ=255) acagctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑gg > 1:212118‑M1/143‑150 (MQ=255) tGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGG < 1:4742801‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGG < 1:4832835‑M1/150‑1 (MQ=255) agctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑GGGt > 1:5079898‑M1/141‑150 (MQ=255) ctgtcctgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑GGGTGa < 2:5677889‑M1/12‑1 (MQ=255) ttGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCCGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAA > 2:4375170‑M1/1‑150 (MQ=255) tGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAAC < 2:630769‑M1/150‑1 (MQ=255) gAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACC < 2:5853785‑M1/150‑1 (MQ=255) ttGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGC < 2:1949481‑M1/150‑1 (MQ=255) tgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccgttcatctcgatgctgcagagacatcagcggtttgcctttccgacctaccgctgagtggtgtattgcatgaaattgactCTTCGA‑GGGTgaaccagc < 2:5394204‑M1/18‑4 (MQ=255) tgggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑GGGTGAACCCGc < 2:3122291‑M1/18‑1 (MQ=255) gggcgatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑GGGTGAACCCGCt > 1:4136795‑M1/132‑150 (MQ=255) tGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTA < 2:3928698‑M1/150‑1 (MQ=255) gatcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTa > 2:2725462‑M1/128‑150 (MQ=255) gATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTAC > 2:6171429‑M1/1‑150 (MQ=255) atcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑GGGTTcacccgcgaagag > 2:1614943‑M1/127‑144 (MQ=255) atcagtgccatccgtcgtgacctggccgaagaggccagtgaattgccggtcatctcgatgctgcagagccagcagcggtttgccttgccgacctaccgctgaggggtgtattgcctgaactggcctCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTAc > 2:4281060‑M1/127‑150 (MQ=255) acacCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACAtt < 2:3100420/150‑1 (MQ=255) 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gCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAAACCCCTCCGAAAGTTACAGCGCCATGCCTAAGGGCGGCGCAACCCGCCGTCCTAGGAGCCGGTTAACCCCCCAAGAGGCCAGTTCATGCAATaca > 2:1667888/1‑150 (MQ=255) cATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCACTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATacac < 2:1399824/150‑1 (MQ=255) aTTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGTACCCCCTCCTAAAATGAATGCGCCATTGCGAACGGGGGCGCAACCCTCGGTGGTAGGGGCGGGTTGACCCCCGCAGAGGCCAGTTAAGGCaaaaaaac > 2:4205812/1‑144 (MQ=255) tttCTTGGTATCGCCGAGCTGTAAGCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACAccc < 2:4098499/150‑1 (MQ=255) tCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCt < 2:4639028/150‑1 (MQ=255) tCGACGAGCTGTCATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTa < 2:6813982/150‑1 (MQ=255) cgacgtGCTGTAATCGCATGGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGACCCCGCTCCTACATTGCCTGCGCGATGCCTACGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAg < 1:3968869/150‑1 (MQ=39) cgacgaGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAg < 2:1242282/150‑1 (MQ=255) aGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTCCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACGGCGCGATGCCTACGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTTGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCgg < 1:3335529/150‑1 (MQ=255) tGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGCGGGGTGAACCC‑CGACCACAGATACAGGGCGGTGCCCAAGGGCGGCCCCACCCGCGGGCGGAGGCGCGGGGTCCCCCCCGCCCAGGCCCGGTAAGGCAAAAAACCCCCCCACGGGGGGTCgggcc > 2:1270868/1‑147 (MQ=255) tGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCggcaa < 2:5201003/150‑1 (MQ=255) tAATCGCTTTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCggcaagg < 1:6724214/150‑1 (MQ=255) tAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAAACCGCTCCGACATTGACTTCGCGGTGCCGAAGGGCGGCGCCACCCGCGGGCGTAGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCCGTGCAGGCAAAACACCCCCCCGCCGGAGGGCggcaacg > 2:6061998/1‑148 (MQ=255) gctttGCCGGCCGCTTGGG‑GGGTGAACCCGCTCCTACTTTGACTGCGCGTTGCCTACGGGCGGCGCAACGGTCGGTCGTAGGTGCGGTTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAAc < 1:5297089/147‑1 (MQ=255) gctttGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTACGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTTGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAAc < 1:4572674/147‑1 (MQ=255) cATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACAGCGCGATGCCGAAGGGCGGCGCAACCCTCGGTCGGAGGAGCGGGGTCACCCCCGGAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAAcc > 2:5626944/1‑150 (MQ=255) ccggccgCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACTTTGCCTGCGCGAGGCCTACGGGCGGCGCAACCGGCGGTCGTCGGAGGGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCgctgc < 1:4888266/150‑1 (MQ=255) ggccgCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACTTTGACTGCGCGATGCCTACGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGGGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGctgctg < 1:1077139/150‑1 (MQ=255) ggccgCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGctgctg < 2:819551/150‑1 (MQ=255) gccgCTTCGC‑GGGTGAACCCGCACCTACAGTGACTGCGCGATGCATAAGGGCGGCGCAACCGGCGGTCGTCGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTgg < 1:4312669/150‑1 (MQ=255) CTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGctct > 2:5340501‑M1/1‑150 (MQ=255) | GCGGCGCTGGGTTGAGTTGGGTGATACACCGTTTTGCCTGGCGTTGCGCTTGTATGGCAGCGAGCAGGGCATGCAGGCGCGGTTTACGGGCGATGTGACTGCGCGGGCATTTCTTGGTATCGACGAGCTGTAATCGCATTGCCGGCCGCTTCGC‑GGGTGAACCCGCTCCTACATTGACTGCGCGATGCCTAAGGGCGGCGCAACCGTCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCAGTTCAGGCAATACACCCCTCAGCGGTAGGTCGGCAAGGCAAACCGCTGCTGGCTCT > NC_002947/2062644‑2062941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |