| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5394322 = | 262 (0.890) | 12 (0.050) | 9/220 | NT | 6.1% | intergenic (+24/‑296) | dld2/PP_4738 | D‑lactate dehydrogenase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 5394431 = | 159 (0.680) | intergenic (+133/‑187) | dld2/PP_4738 | D‑lactate dehydrogenase/hypothetical protein | |||||
GGTGTTCGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5394497‑5394322‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggtaaacccgctcctacgcagATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACCT > NC_002947/5394431‑5394579 GGTGTTCGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCT > 1:1441596/1‑150 GTGTTCGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTT < 1:4222293/150‑1 GTTCGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCG > 2:1841758/1‑150 GTTCGCGGGTTTAACGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCG > 2:1841734/1‑150 TTCGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCATTCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGC < 2:2689613/150‑1 TTCGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGC < 2:6672504/150‑1 TCGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCG < 2:1641641/150‑1 TCGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCG < 2:5307657/150‑1 CGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGG < 2:4649811/150‑1 CGCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGG < 1:406580/150‑1 GCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTGCGCGGG > 1:6660938/1‑150 GCGGGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGAGTGGCCCGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGG > 1:6643639/1‑150 GGTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAA > 2:2873037/1‑150 GTTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAA > 2:5388009/1‑150 TTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 2:5266781/150‑1 TTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 2:6594325/150‑1 TTTACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 1:2527969/150‑1 TACCGCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC < 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GCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 2:5732604/150‑1 GCGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 2:5858810/150‑1 CGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTTTACCCGCgaa < 2:363421/150‑4 CGCATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTTTACCCGCgaa < 2:363669/150‑4 CATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 2:2555010/150‑1 ATACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCCTGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACCGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > 1:4164042/1‑150 TACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG > 2:1141407/1‑150 ACGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC < 2:4495724/150‑1 CGGCGGGCTGTGTACACCCACCGCTGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGATTGGGGTGGTGGCTGCGGTGGACTGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA < 1:3139359/150‑1 CGGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCAGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA < 2:3462833/150‑1 GGCGGGCTGTGTACACCCACCGATGTGTGGGCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCTGCGGTGGACAGTGGGTGGGGATTGGCCAGCGGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAG > 2:1021097/1‑150 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1:553632/1‑150 GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCG > 1:1702760/1‑150 GGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACCCCGGCACCGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCCCCACCATCCCGATGGAACCCCCGC < 2:2599055/150‑1 GGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGCGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGC < 1:5742440/150‑1 AAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAA < 1:6241912/150‑1 ACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATC > 1:6387866/1‑150 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2:1769158/1‑150 AGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACC > 2:4393748/1‑150 AGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACC < 2:2687177/150‑1 AGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACC > 1:921554/1‑150 AGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACC > 1:86029/1‑150 AGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACC < 1:5971408/150‑1 AGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACC < 1:5971144/150‑1 AGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACC > 1:4789927/1‑150 AGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACC > 1:1345005/1‑150 GATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCACTATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACCT < 2:3342098/150‑1 GATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACCT < 1:5953213/150‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |