| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5394322 = | 262 (0.890) | 12 (0.050) | 9/220 | NT | 6.1% | intergenic (+24/‑296) | dld2/PP_4738 | D‑lactate dehydrogenase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 5394431 = | 159 (0.680) | intergenic (+133/‑187) | dld2/PP_4738 | D‑lactate dehydrogenase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
GCCACGCAGCCTCTAACGCGTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACCT > NC_002947/5394283‑5394579 | gCCACGCAGCCTCTATCGCGTTGATATAGGTGGGGAGCGGTGCGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCCCTGTCCCCCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGAt < 1:6857174/150‑1 (MQ=37) cACGCAGCCTCTAACGCGTTGATATCGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACGGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATtg < 1:1285178/150‑1 (MQ=255) cACGCAGCCTCTAACGCGTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTCCAGCTGGCCCATCCCCCCCCACTGTCCACCCCAGCCACCACCGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACGCCGAAtg > 1:1344351/1‑150 (MQ=37) cACGCAGCCTCTAACGCGTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATtg < 2:3122837/150‑1 (MQ=255) aGCCTCTAACGCGTTGATCTAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTggtggt < 1:6517377/150‑1 (MQ=255) ccTCTATCGCGTTGATTTAGGTGGGGTGCGCTGCGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGc < 1:5198517/150‑1 (MQ=37) ctctAACGCGTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGcc > 2:3646283/1‑150 (MQ=255) ctctAACGCGTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGcc > 2:5317602/1‑150 (MQ=255) aaCGCGTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGCTTGGTGGTGCCcaca > 2:6544235/1‑150 (MQ=255) cgcgTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCcacaca < 2:5131442/150‑1 (MQ=255) gcgTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCGGTCCTGCTGGCCAAACCCCACCCACAGTCCACCGCAGCCACCACCCCAAACGCGGGTAAACCCGCACCAACCCACAATGGTGGTGCCcacacaa > 1:3379742/1‑149 (MQ=37) gcgTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATAGGTGGTGCCCACACAt > 1:5669812/1‑150 (MQ=255) gTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCg < 2:6116963/150‑1 (MQ=255) tGATATCGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCCCTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggt < 1:3279661/150‑1 (MQ=255) tGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggt < 1:6772411/150‑1 (MQ=255) tGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggt < 2:3254604/150‑1 (MQ=255) tGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGGCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggt < 1:5166190/150‑1 (MQ=255) gtttttggTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACGGTCCACCGCAGCCACCCCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggtg < 1:6719712/144‑1 (MQ=37) gATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggtg < 2:4056466/150‑1 (MQ=255) atatAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggtgg < 2:3939190/150‑1 (MQ=255) atatAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggtgg < 2:6063471/150‑1 (MQ=255) atatAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggtgg < 2:4348300/150‑1 (MQ=255) ataGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggtgggt < 1:4347738/150‑1 (MQ=255) agcggTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAAGCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCggtgggt < 2:6257961/147‑1 (MQ=255) gggAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTAcaca < 2:5578907/150‑1 (MQ=255) ggAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAg < 2:3888444/150‑1 (MQ=255) aGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGcc < 2:2994336/150‑1 (MQ=255) CTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCccgcc > 1:3439795‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCccgcc > 2:6410191‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCCGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCccgcc > 2:1021097‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCccgccg < 2:3462833‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACAGTCCACCGCAGCCACCACCCCAATCGCGGGTAAACCCGCTCCAACGCAGATTGGTGGTGCCCACACAGCGGTGGGTGTACACAGCccgccg < 1:3139359‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGt < 2:4495724‑M1/150‑1 (MQ=255) CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTa > 2:1141407‑M1/1‑150 (MQ=255) GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACGGTCCACCGCAGCCACCACCGCAGGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTAt > 1:4164042‑M1/1‑150 (MQ=255) ttcGCGGGTAAACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATgcg < 2:363421‑M1/147‑1 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATgcgc < 2:2175490‑M1/150‑1 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATgcgc < 2:5858810‑M1/150‑1 (MQ=255) 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tacccgcgaatgcggtggtggctgcggtggacagtgggtggggattggccagcaggaccggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacgcagCTTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAAccc > 1:1121605‑M2/93‑150 (MQ=255) cccgcgaatgcggtggtggctgcggtggacagtgggtggggattggccagcaggaccggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacgcagCTTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCcgc > 2:2007710‑M2/91‑150 (MQ=255) CCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCcgcg < 2:4649811‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGaa < 2:6672504‑M1/150‑1 (MQ=255) CGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAac > 2:1841758‑M1/1‑150 (MQ=255) ggccTGCCGGCCCATCCCCTCCGACTGTCCCCCGCAGCCCCCTCCGCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGTTTGGTGGTTCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGc < 1:3632271/148‑1 (MQ=37) ctgGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCGTTGCCGGTgt < 1:180272/150‑2 (MQ=255) tgGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGTTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGcc > 1:5664943/1‑150 (MQ=255) gCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCCCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCAt > 1:6246805/1‑150 (MQ=255) ccAATCCCCACCCCCTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATc < 1:2696183/150‑1 (MQ=255) 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agATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCAcc > 1:86029‑M2/3‑150 (MQ=255) | GCCACGCAGCCTCTAACGCGTTGATATAGGTGGGGAGCGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCTGGCCAATCCCCACCCACTGTCCACCGCAGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGCCCACACATCGGTGGGTGTACACAGCCCGCCGTATGCGCGGTAAACCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATCCCTACTTCAATATCGCCCCGCCACCATCCCGATGGAACCCCCGCCAATCCCCCGCAGTCCACCT > NC_002947/5394283‑5394579 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |