New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6060157 | 212 (0.720) | 20 (0.070) | 8/258 | NT | 8.7% | coding (105/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB |
? | NC_002947 | = 6060197 | 220 (0.800) | coding (145/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB |
CGGCCGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/6060001‑6060157 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggtgccaGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTTCT < NC_002947/6060197‑6060049 CGGCCGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTC < 2:4455730/150‑1 GGCCGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCG > 2:2204576/1‑150 GGCCGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCG > 2:3676174/1‑150 CCGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGT < 1:702666/150‑1 CGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTG > 1:6804366/1‑150 CGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTG < 2:2866470/150‑1 CGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTG < 2:6672227/150‑1 CGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTG < 2:6736144/150‑1 GGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTac > 2:3402348/1‑148 GGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGC < 1:3942766/150‑1 GGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGC < 1:6848119/150‑1 cgACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCACCTGGTCGGTGCCA < 2:4124347/148‑1 CTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA < 1:729430/150‑1 CGGCAGCCAAGAAATGATGAACACGCGCTCTAACCTGGCGCGCTCCGGTGGCCGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGAT < 2:5349434/150‑1 CGGCAGCCAAGAAATGATGAAACCGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGGGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGAT < 2:5542099/150‑1 CGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGAT < 1:5207394/150‑1 CGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGAT < 2:5349533/150‑1 CGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGAT < 2:2076863/150‑1 CAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCT > 1:4684412/1‑150 CAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGT < 1:5679693/150‑1 CAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGT < 1:5511759/150‑1 CAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGT < 1:2046124/150‑1 CAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGA < 1:6805049/142‑1 CAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGA > 2:6805049/1‑142 CAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGT < 2:6405119/150‑1 CAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGT < 2:6405239/150‑1 AGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑CAGGCCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGG < 1:4517221/150‑1 ATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCG < 1:1768630/150‑1 ATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCG < 1:274079/150‑1 ATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCG < 1:5231158/150‑1 TGAAAACGCGCTCTATCATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGTTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCTGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGTGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGA < 1:981305/150‑1 TGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGA < 1:6090479/150‑1 CGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGA < 2:4684412/150‑1 CGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCTGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCAT < 1:5134854/150‑1 CGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCAT < 2:6820617/150‑1 CGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCAT < 2:6820238/150‑1 CGGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCAT < 1:4797373/150‑1 GGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATC > 1:830188/1‑150 GGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATC > 1:2143755/1‑150 GGTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATC < 2:2143755/150‑1 GTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCA < 2:6048561/150‑1 GTGCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGGGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCA > 1:6526234/1‑150 GCCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATT > 1:1764814/1‑150 CCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTT > 1:6244482/1‑150 CCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTT > 1:6244645/1‑150 CCAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTT > 1:527419/1‑150 CAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTTC < 2:4534246/150‑1 CAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTTC < 2:4534316/150‑1 CAGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTTC < 2:4534362/150‑1 AGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTTCT < 2:408236/150‑1 AGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTTCT > 2:275572/1‑150 AGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTTCT < 2:2361448/150‑1 CGGCCGGCTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/6060001‑6060157 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggtgccaGTTCGACCATCATCGCTGCCGGGGGCAGCTCGATGGCCTGTGGCACCGACCAGTTGAGCGTCAGCAGCACGGCGACCACGTGCACACCCAGCACGATCGCCAGGCTGCCACCGTAGCGCGCCATGTTAGAGCGCGTTTTCATCATTTCT < NC_002947/6060197‑6060049 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |