| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 6060197 | 220 (0.800) | coding (145/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB | |||||
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
CTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCC > NC_002947/6060008‑6060306 | ccTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGCGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAg > 2:6363206/1‑150 (MQ=255) cTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAgg > 2:899981/1‑150 (MQ=255) cTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAgg > 2:378227/1‑150 (MQ=255) 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cGGTGCCAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcat < 2:6820617‑M1/150‑143 (MQ=255) cGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcat < 1:1768630‑M2/150‑103 (MQ=255) ggTGCCAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatc > 1:830188‑M1/1‑7 (MQ=255) gTGCCAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgggcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatca > 1:6526234‑M1/1‑6 (MQ=255) gTGCCACAGGCCATCGAACTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgccc > 1:2765401/1‑150 (MQ=255) tGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgccca > 2:2651285/1‑150 (MQ=255) gCCACATGCCATCGAGCTGCCCCGGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCAACACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCTGTCGAGGAACCAACGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaa < 2:2171132/150‑1 (MQ=255) gCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaa < 2:2145480/150‑1 (MQ=255) gCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaa < 1:4671307/150‑1 (MQ=255) ccAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcattt > 1:527419‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcattt > 1:6244482‑M1/1‑3 (MQ=255) cacaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagc < 1:899981/150‑1 (MQ=255) agttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcatttct < 2:2361448‑M1/150‑150 (MQ=255) acaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCTG‑ggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcatttcttg < 2:6405119‑M2/150‑111 (MQ=255) acaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagcc > 2:1720152/1‑150 (MQ=255) acaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagcc > 1:4026647/1‑150 (MQ=255) acaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGCCTG‑ggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcatttcttg < 1:5511759‑M2/150‑111 (MQ=255) | CTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCC > NC_002947/6060008‑6060306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |