| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 835064 | 279 (0.950) | 15 (0.050) | 8/266 | NT | 5.5% | coding (1018/1713 nt) | PP_0718 | sulfate transporter |
| ? | NC_002947 | = 835114 | 242 (0.850) | coding (968/1713 nt) | PP_0718 | sulfate transporter | |||||
Only 100 of 348 total aligned reads displayed.
GAACTCCCACTGCTGCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTT > NC_002947/834915‑835211 | cTCCCACTGCTGCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGgc < 2:1651168/150‑1 (MQ=255) tCCCACTGCTGCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGgcg > 1:320017/1‑150 (MQ=255) tCCCACTGCTGCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGgcg > 2:5607773/1‑150 (MQ=255) cACTGCTGCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCg > 2:2442374/1‑150 (MQ=255) ctgctgCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCgat < 2:8270/150‑1 (MQ=255) ctgctgCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCgat < 2:7750/150‑1 (MQ=255) ctgctgCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCgat < 2:6239758/150‑1 (MQ=255) ctgcATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCgatgat < 1:443794/150‑1 (MQ=255) cATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGcc > 1:4848999/1‑150 (MQ=255) aTGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCg > 1:907683/1‑150 (MQ=255) gAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAg > 2:1483681/1‑150 (MQ=255) gAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAg < 1:5344762/150‑1 (MQ=255) gAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTAGGCGCTACCAGCATCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAg > 1:3639688/1‑150 (MQ=255) gATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTg > 1:5506856/1‑150 (MQ=255) aTACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTgg < 2:2218923/150‑1 (MQ=255) aCGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGt < 1:958665/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCt > 1:2010876/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCt < 2:6334148/150‑1 (MQ=255) 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tGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCa > 2:5209543/1‑150 (MQ=255) gcgcTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGc < 1:245676/150‑1 (MQ=255) gcgcTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGc > 2:1965624/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGAc > 1:3761442/1‑150 (MQ=255) agcagcATCAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCGGACACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCg > 2:4458884/1‑150 (MQ=255) agcagcAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCg > 2:1876564/1‑150 (MQ=255) agcagcAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCg > 1:1613031/1‑150 (MQ=255) agcagcAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCg > 1:6343434/1‑150 (MQ=255) gcagcaACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGc < 1:4242989/53‑1 (MQ=255) gcagcaACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGa > 2:3400686/1‑150 (MQ=255) gcagcaACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGa > 2:2115081/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACAtt > 1:1435889/1‑150 (MQ=255) gggTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCt > 1:2816254/1‑150 (MQ=255) gggTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCt < 2:5388423/150‑1 (MQ=255) ggTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGt < 1:6048670/73‑1 (MQ=255) ttACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGt > 1:5228397/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTgg > 2:4840327/1‑150 (MQ=255) cGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGCCCGAACATGTCCTGGTTggg > 1:5295244/1‑150 (MQ=255) cGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTggg < 1:2965031/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTgggg > 2:5713145/1‑150 (MQ=255) gCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTgggg > 1:5643622/1‑150 (MQ=255) ccAGtggccgaagctgccggctcgcagacccagctcaccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatctgatgcagcacctgcctaacagcgctttggctgcggtggtgattgccgctgcactgggg < 1:2300186‑M1/150‑147 (MQ=255) cAGtggccgaagctgccggctcgcagacccagctcaccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatctgatgcagcacctgcctaacagcgctttggctgcggtggtgattgccgctgcactggggc > 1:2265260‑M1/1‑3 (MQ=255) cAGtggccgaagctgccggctcgcagacccagctcaccggcatcatcggcgccctggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatctgatgcagcacctgcctaacagcgctttggctgcggtggtgattgccgctgcactggggc < 2:6845706‑M1/150‑148 (MQ=255) cAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCActggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatctgatgcagcacctgcctaacagcgctttggctgcggtggtgattgccgctgcactggggc < 1:681308‑M2/150‑98 (MQ=255) cAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCActggcggtaaccctgttgctgctggtagcgcccaatctgatgcagcacctgcctaacagcgctttggctgcggtggtgattgccgctgcactggggc < 1:1091971‑M2/150‑98 (MQ=255) cAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGtt < 1:737053/150‑1 (MQ=255) | GAACTCCCACTGCTGCATGCGGAAGATACGCTTGAGGTCGGCAAATTCGAACAGCCCCAGTGCAGCGGCAATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTT > NC_002947/834915‑835211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |