New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1424502 = | 162 (0.550) | 14 (0.050) | 4/244 | NT | 6.8% | intergenic (‑36/+101) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5243643 | 239 (0.920) | coding (158/204 nt) | PP_5701 | hypothetical protein |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
GACCGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTC > NC_002947/5243495‑5243792 | gACCGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCg < 1:2877287‑M2/150‑2 (MQ=255) ccGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGTCCggc < 2:689434‑M2/150‑4 (MQ=255) gATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcct > 1:2001726‑M2/1‑145 (MQ=255) aTTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctc < 1:6261650‑M2/150‑7 (MQ=255) gCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttc > 1:1801872‑M2/1‑141 (MQ=255) cGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttcgc < 1:3891564‑M2/150‑12 (MQ=255) cGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttcgc < 1:74367‑M2/150‑12 (MQ=255) cGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttcgc < 2:1369565‑M2/150‑12 (MQ=255) cGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttcgc < 2:5391463‑M2/150‑12 (MQ=255) cAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttcgcgg > 2:4227675‑M2/1‑137 (MQ=255) aaGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttcgcggg > 2:844612‑M2/1‑136 (MQ=255) gCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTc < 2:3886582/150‑1 (MQ=255) gCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTc < 1:3285709/150‑1 (MQ=255) gCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTc > 1:194180/1‑150 (MQ=255) aCCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGc > 1:6326904/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGcc < 2:2781299/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGcc < 2:4083964/150‑1 (MQ=255) tGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGc < 1:3749664/150‑1 (MQ=255) ggCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttcgcgggcgagcccgcgaa > 1:3851732‑M2/1‑124 (MQ=255) cATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCggcctcttcgcgggcgagcccgcgaaga > 1:6504976‑M2/1‑122 (MQ=255) tGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCcaca < 1:3003736/150‑1 (MQ=255) gCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGc < 2:5123163/150‑1 (MQ=255) gCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGc < 2:5191773/150‑1 (MQ=255) aCGATGCATGAACAGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGATCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCgg > 2:5912582/1‑150 (MQ=255) tGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTcac < 1:4510185/150‑1 (MQ=255) cATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTcacca < 1:3129092/150‑1 (MQ=255) aTGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTcaccac > 1:6633205/1‑150 (MQ=255) aCTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACagta < 2:3420885/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACagtagt < 1:514266/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTc < 2:1911595/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCaa < 2:6848092/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCaa < 1:3070419/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCTCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGa < 2:637246/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGa < 2:2594519/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACtt < 1:3154780/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACtt > 2:5703904/1‑150 (MQ=255) ctctTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGt > 2:741931/1‑150 (MQ=255) tcttctTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTa > 1:4997456/1‑150 (MQ=255) tcttctTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTa > 1:3479545/1‑150 (MQ=255) cttcttGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTAc < 2:2010110/150‑1 (MQ=255) ttcttGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCCCAGTAGACAAGACTTGCACAGTAcc > 1:4644533/1‑150 (MQ=255) tcttGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCt > 1:3599060/1‑150 (MQ=255) ttGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCCCAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCtgt > 1:4805874/1‑150 (MQ=255) 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aTGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTACCGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGc < 2:6014538/150‑1 (MQ=255) aTGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGc > 2:6538015/1‑150 (MQ=255) ccGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTACCGTGCCGGTAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGa < 2:3671077/150‑1 (MQ=255) gAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGc < 2:5259387/150‑1 (MQ=255) cccAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGca < 1:6402181/102‑1 (MQ=255) cccAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGa > 2:420134/1‑150 (MQ=255) cccAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGa < 2:2605731/150‑1 (MQ=255) aGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACaa > 2:3968233/1‑150 (MQ=255) ttCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCACCCCCAGCCGTCACCACAGTAGTAAAGACTTGAACAGTACCAGTGGGAGACGCCGTGCCCCCCAAACGGCCCGCCCAGCCGACaaaaaacc > 1:5793476/1‑145 (MQ=255) tCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGcaca < 2:6097627/94‑1 (MQ=255) cGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATcccc < 2:1932180/150‑1 (MQ=255) tAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCCGTCACCACAGTAGTCAAGACGTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAAGGGCCCGACCGGCCCACAAAAATCCCCCGCCa > 1:1918719/1‑150 (MQ=37) aaGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCAt < 2:3123872/150‑1 (MQ=255) cTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATACCCGGCCCTGCAc > 2:781349/1‑150 (MQ=255) ttAACGTGCCGGATGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTc < 1:3365862/150‑1 (MQ=255) tAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCg > 2:3621118/1‑150 (MQ=255) accGTGCCGGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCCCCGCGGTCACCACCGTAGTCAAGACGTGCACCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGc < 2:3003266/148‑1 (MQ=37) tGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACCGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAgcc < 1:1045524/150‑1 (MQ=255) tGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCAGCCGACAAAAAAACCCCGCCAAGCACCGTCGCAgcc > 1:4938908/1‑150 (MQ=37) cGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCAACAGCGGTAACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCACCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACACATATCCCCGGCCATGCACCGACGCAgccccc > 2:6477855/1‑150 (MQ=37) ggAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGGCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACCAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAgccgccc > 2:4914156/1‑149 (MQ=255) gAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa < 1:917195/98‑1 (MQ=255) gAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCAc > 2:2779514/1‑150 (MQ=255) aaGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCCCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCCAAAGGGCCGGACCCGCCGCCCAAAATCCCCCGCCATGCACCCTACCAACCCCCAcc > 1:604352/1‑150 (MQ=255) gccggccTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATACCCCGCCATGCACCCTCGCAGCCGCCACCCCAt > 1:1125156/1‑150 (MQ=255) ccggccTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCgg < 1:522831/99‑1 (MQ=255) cggccTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTc < 2:194379/150‑1 (MQ=255) | GACCGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTC > NC_002947/5243495‑5243792 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |