| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5908776 = | 232 (0.790) | 34 (0.130) | 17/242 | NT | 14.9% | intergenic (+27/+80) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | 5908836 = | 183 (0.710) | intergenic (+87/+20) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
TTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGCCTGGCGGCTGAAGTACCAG > NC_002947/5908687‑5908985 | ttGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCCGGCCTTCCCCCAACCACACGGCTCAACACAACCCAAGAAGCTTTGTGGTCCCCGTGGGAGCGGGCg > 1:4099940/1‑150 (MQ=255) aGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCAGAAGGCTGTGAGGTCCCGGTGGGAGCGGGCGTGc > 1:4975603/1‑150 (MQ=255) tGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCAGAAGGCTGTGAGGTCCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 2:1869805/1‑150 (MQ=255) tGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCGCCCACACGGCTCACCACAACCCAGAACGCGGTGAGGTCCCGGTGGGAGCGGGCGTGcccccc > 1:3907714/1‑147 (MQ=255) gATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCCCGCCCACACGGCGAACCAAAACCCAGAAGGCTGTGAGGTCCCGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGaa > 1:1878074/1‑150 (MQ=255) ttGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCGGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCAGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAg < 2:5127244/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGATGTATCAGGGACTATCCACATGGGGATGCGGTATGGCTTTGATTCGGGGCTGGCGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg < 2:1137320/150‑1 (MQ=38) ggTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCCCAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAggg > 2:4988534/1‑150 (MQ=255) tCAGAAGTATCTGGTACTATCCACTTTGGGATGCGTTTTGGATTTTAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGcc < 1:2108190/150‑1 (MQ=38) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATTCCCGCGCCCACCGGGCTCACCACCACCCCGAAGGCGGGGAGGTCCCGGGGGGGGGGGGCGTGCCCGCGAAAggggc > 1:1384901/1‑148 (MQ=255) aGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGTCGGCGGTAGGGCTTTGAATGGGTGGTGGAGCCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACCGGGCTCACCAAAACCGTGATGGCTGTGTGGTCCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAg < 1:4912824/150‑1 (MQ=255) aGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAg < 2:227573/150‑1 (MQ=255) aGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTAACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAg > 1:6219390/1‑150 (MQ=255) 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ccTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGcga > 1:4338860/1‑150 (MQ=255) cTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGcgac > 1:1088925/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGcgacg > 2:6362826/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGcgacg > 1:3871452/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGcgacg > 1:6296543/1‑150 (MQ=255) aaGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCgacgac > 2:6150958/1‑150 (MQ=255) cTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGctc > 2:6789474/1‑150 (MQ=255) tgtgAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGctct > 1:6250188/1‑150 (MQ=255) gAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCg > 2:2137482/1‑150 (MQ=255) gAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCg > 1:5389527/1‑150 (MQ=255) gTCCGTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCgtct < 1:844546/150‑4 (MQ=255) gTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGcc > 1:3562692/1‑150 (MQ=255) tCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGCCt > 2:3101048/1‑150 (MQ=255) cctgtgggagcgggcGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGCCTgg > 2:565196‑M2/16‑150 (MQ=255) cggtgggagcgggcGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCGTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTGCGGCCTggc > 2:3505603‑M2/15‑150 (MQ=255) tgtgggagcgggcGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGCCTggcg > 1:2274975‑M2/14‑150 (MQ=255) ttcgcgggcACGCCCGCTAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGCCTggc < 1:4717732‑M2/136‑1 (MQ=255) ggagcgggcGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACACTCTTCGGCCTGGCGGCTg > 1:5694233‑M2/10‑150 (MQ=255) cGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGCCTGGCGGCTGAAGTACCa < 1:4538882‑M2/149‑1 (MQ=255) gTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGCCTGGCGGCTGAAGTACCAg < 2:4941876/150‑1 (MQ=255) | TTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGCTGAATCGCCTTGCGACGACGCTCTTCGGCCTGGCGGCTGAAGTACCAG > NC_002947/5908687‑5908985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |