| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5739046 | 181 (0.570) | 37 (0.130) | 16/248 | NT | 16.9% | intergenic (‑67/+90) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
| ? | NC_002947 | = 5739101 | 199 (0.690) | intergenic (‑122/+35) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase | |||||
TAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5738888‑5739046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccttcgcgggcGCGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGCTGCGCAGCAGCCCCCTGAATCTCACGACCACAAAAACAATTCAAGGACGTGACATGCAACAAGCTCAAGGTCTCAAGCG < NC_002947/5739101‑5738954 TAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCC > 2:784927/1‑150TAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCGCAGCAGCCCC < 1:7215684/150‑1TAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAAGTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCg > 2:5391159/1‑149 GAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTT > 2:1621265/1‑150 GAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTT < 2:6736250/150‑1 AAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTC < 1:4394876/150‑1 AAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTTAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCctgaa < 2:3974465/150‑6 AAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGC < 1:1008414/150‑1 AAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGC < 2:498551/150‑1 AAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGC > 1:4680513/1‑150 AAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGC < 2:6336010/150‑1 AAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGC < 2:7357111/150‑1 AAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGC < 2:7357196/150‑1 AGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCG < 2:5629547/150‑1 AGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCG < 1:869662/150‑1 AGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCG < 2:5629702/150‑1 AGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCG < 1:869356/150‑1 GGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGG < 1:368976/150‑1 GGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGG < 2:3927306/150‑1 GGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGG < 2:1731060/150‑1 CCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGC < 1:7007467/150‑1 CCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGC > 1:6460745/1‑150 CGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCG > 1:5337741/1‑150 GGCGGAGCCGAGGGCCATGAATCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCC < 2:1036800/150‑1 GGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaa < 2:4292366/150‑4 GGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaa < 2:4293324/150‑4 GGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTAGCGGGCGTGCCCGCgaa < 1:3226132/150‑4 GCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCCGCTGGGC‑GGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCA < 1:1584051/150‑1 CGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTGTGGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTAGCGGGCGTGCCCGCgaagg < 1:1576932/150‑6 GGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaaggg < 2:6791314/150‑7 GGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaaggg < 2:7249289/150‑7 GGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTGAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaaggg < 2:6791295/150‑7 CCGAGGGCCATGAAACGGTTGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCATCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGAA < 1:2950792/150‑1 GAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGAAGT < 2:1067691/150‑1 GAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAAGT < 1:1943584/150‑1 AGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCCGCTGGGC‑GGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGAAGTAG < 2:5706204/150‑1 CCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTG > 2:4731945/1‑150 AACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaa < 2:5926833/130‑4 AACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCAGCgaa > 1:5926833/1‑127 GGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGT < 1:2376803/150‑1 GGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGT < 2:274667/150‑1 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AGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGGTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGTGGGAGCGG < 2:7436814/150‑1 cCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGTGGGAGCGGG < 1:389029/149‑1 GCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGTGGGAGCGGG < 1:6221617/150‑1 CGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGTGGGAGCGGGCGT < 2:4031764/150‑1 CGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGTGGGAGCGGGCGTGC < 2:6905423/150‑1 TGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGTGGGA > 1:3209637/1‑99 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1:5308048/1‑150 TAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5738888‑5739046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccttcgcgggcGCGCCCGCTCCCACAGAAGTAGGTGCAAAACACCATCCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGCTGCGCAGCAGCCCCCTGAATCTCACGACCACAAAAACAATTCAAGGACGTGACATGCAACAAGCTCAAGGTCTCAAGCG < NC_002947/5739101‑5738954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |