| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 5739046 | 181 (0.570) | 37 (0.130) | 16/248 | NT | 16.9% | intergenic (‑67/+90) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
| ? | NC_002947 | = 5739101 | 199 (0.690) | intergenic (‑122/+35) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase | |||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACA > NC_002947/5738897‑5739194 | tGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGc < 2:3203215/150‑1 (MQ=255) ccGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGccc < 2:2149166/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGACTTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCg > 1:5210770/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCt < 2:5721388/150‑1 (MQ=255) ggCGGAGCCGAGGGCCATGAATCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCgcgcccgctcc < 2:1036800‑M1/150‑12 (MQ=255) ggCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCgtgcccgcgaa < 2:4292366‑M1/150‑12 (MQ=255) ggCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTcc < 1:3555341/150‑1 (MQ=255) gCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCCGCTGGGC‑GGCCCTTCGCGGGCgcgcccgctccca < 1:1584051‑M1/150‑14 (MQ=255) 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2:3932885/1‑150 (MQ=255) ttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCACCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACGTATGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGAAGGGCCGCCCACCGGCCCCAGGGGCGTTAAAGGCTTgg > 2:6238910/1‑150 (MQ=255) ttttGGGGGCGTGCGTTTCAGGGGGCGGCGGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGTTGGTGTTTTGCACCTACTACTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTgg < 2:2514424/150‑1 (MQ=255) ttgggggTCGTGAGAGTCCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACCGGGGATGGTTTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGc < 2:1579874/145‑1 (MQ=255) ttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACGTCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCa > 2:526240/1‑150 (MQ=255) gtggggTCGTGAGAGTCAGGGGGCTGCGGCGCCGCCCATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCa < 1:7367879/146‑1 (MQ=39) tgtgGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAg < 2:5725021/150‑1 (MQ=255) gtgGTCGTGAGATTCTGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGt < 1:5514369/150‑1 (MQ=255) ataTTCTGGGGGTTGCTGGGCAGCCCCTGCGGGGGCACGCCCGCTCCCCCCGGTGTTGGTTTTTGCCCCCTACTTCTGGGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACccgcc < 1:3808087/148‑1 (MQ=255) ggCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGc < 2:5471022/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGCTGGTGGTTTGCCCCGGCGTCTGTGGGGGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCCCCCCGCGGCCCCCGGGGCGGTACAGGCTTGGCAGTACACCCCCCGGCACCAAGcccg > 2:788548/1‑148 (MQ=255) gctgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGGTGGTGTTTTGCCCCTACGTCGGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCCGCGGCCCCCGGGGCGTTACAGGCGTGGCAGTACACCCGCCGGCCGCAACCCGGt > 2:6940118/1‑150 (MQ=255) gctgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGt < 2:6052308/150‑1 (MQ=255) ggcgcAGCCCCTGCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGTATGGTGTTTGGCACCTACTTCTGTGGGAGGGGCCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCa < 1:6406082/149‑1 (MQ=255) gcAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCCCAGGGGCTGGTGGTTTGCACCGACTTCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCCCCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGAc > 2:5112370/1‑150 (MQ=255) aGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACCGGGGATGGTGTGTTGCACCTACGTCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCCGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACCCCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACtc > 2:6622349/1‑149 (MQ=255) cccccTGCGCGGGCACGCCGGCGCCCCCCGGGTATGGTGTTTTGCCCCTACTTCTGGGGGCGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTAc < 1:4992096/149‑1 (MQ=255) ccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCCGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCCGACTAcccg > 2:4451536/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGGGCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccctgggggagcgggcgtgcccgcgtaggggctgcgcagcagccccctgaatatcacgaccacaaaaacaattaaaggacctgacatgcaaaaagctcaaggt > 1:4944162‑M1/1‑10 (MQ=255) cTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCtt > 2:1222354/1‑150 (MQ=255) gcgcgGGCAGGCCGGGTCCCCGTGGGGTTGTTTTTTTGCACTTACTTGTGGGGGGGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTgg < 1:6238910/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaacaagctcaaggtctc < 2:7170113‑M1/150‑144 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACTGGGGTTGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGTGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGcc < 1:7223865/150‑1 (MQ=255) ggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAAc > 1:1474544/1‑150 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaacaagctcaaggtctcaagcg < 2:6905423‑M2/150‑94 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACa > 1:7109769/1‑150 (MQ=255) | CCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACA > NC_002947/5738897‑5739194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |