| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1973035 | 316 (0.990) | 29 (0.100) | 11/246 | NT | 8.6% | intergenic (‑54/+104) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase |
| ? | NC_002947 | = 1973094 | 333 (1.160) | intergenic (‑113/+45) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase | |||||
Only 100 of 463 total aligned reads displayed.
GGCCTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGC > NC_002947/1972886‑1973184 | ggCCTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTT > 1:2479522‑M1/1‑150 (MQ=255) gCCTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGttt < 1:6121190/150‑1 (MQ=255) cTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATTGTAGGAGCGGGTTcac < 1:3318137‑M1/150‑4 (MQ=255) gCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:5063789/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGaa > 1:1147605/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAt < 2:100129/150‑1 (MQ=255) gcgGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGc < 1:6895360/150‑1 (MQ=255) gcgGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGc < 1:6464752/150‑1 (MQ=255) gcgGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGc > 1:5362453/1‑150 (MQ=255) gCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGACTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTc < 2:3197472/150‑1 (MQ=255) cACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTcc > 1:6726855/1‑150 (MQ=255) cACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGCTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTcc < 2:2595270/150‑1 (MQ=255) cAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGAt > 1:5796025/1‑150 (MQ=255) aTGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCa > 2:7221724/1‑150 (MQ=255) ccACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGgc > 2:5207133/1‑150 (MQ=255) cACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGgcg > 2:3401193/1‑150 (MQ=255) gccggcACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAg < 2:6564986/150‑1 (MQ=255) gcACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGtt < 2:4152818/150‑1 (MQ=255) aCCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGt > 2:6918169/1‑150 (MQ=255) ggTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCg > 1:5962689/1‑150 (MQ=255) ggTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCg < 1:3962677/150‑1 (MQ=255) aCCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCt < 1:2147875/150‑1 (MQ=255) aGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGgc < 2:4915415/150‑1 (MQ=255) 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ccGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTcgc > 1:2357015/1‑150 (MQ=255) ccGGCCGTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACCTGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgactgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgc < 2:2484163‑M1/150‑55 (MQ=255) cGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGa < 1:2591302/114‑1 (MQ=255) ggCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgg < 2:588478‑M1/150‑57 (MQ=255) ggCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCgg < 1:2759358/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCgg < 2:2228027/150‑1 (MQ=255) acccgctggaactgcgcaaagtgatcgacagcgcgctgtgcgggtgctgaacccagaccgatgaccgggcaccgcccttttGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCgg > 2:5798882‑M1/82‑150 (MQ=255) ccTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGt < 2:5276292/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGa < 1:5474083‑M2/150‑2 (MQ=255) tGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaa > 2:2981111‑M2/1‑148 (MQ=255) 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ggAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgac < 1:2778431‑M1/150‑141 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACttt < 1:6010804‑M1/145‑1 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCa < 1:5821412‑M1/150‑1 (MQ=255) aGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacct > 2:6144807‑M1/1‑8 (MQ=255) AGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTc > 1:6822262‑M1/1‑135 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGt < 1:4304887‑M1/150‑1 (MQ=255) cGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccga > 2:6058710‑M1/1‑6 (MQ=255) GGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTc < 1:1858943‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTc > 2:6778228‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTcc < 2:4200583‑M1/150‑1 (MQ=255) gTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacctgctgc > 1:3013305‑M1/1‑3 (MQ=255) gTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacctgctgc > 2:4852665‑M1/1‑3 (MQ=255) cattacCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacctgctgc < 2:4674858‑M2/148‑89 (MQ=255) GTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCa < 2:543305‑M1/150‑1 (MQ=255) GTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCa < 1:3058212‑M1/150‑1 (MQ=255) TTACCCGCGACTGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGGTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTTCAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTGAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGc > 2:2081210‑M1/1‑150 (MQ=255) | GGCCTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGC > NC_002947/1972886‑1973184 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |