| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1973035 | 316 (0.990) | 29 (0.100) | 11/246 | NT | 8.6% | intergenic (‑54/+104) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase |
| ? | NC_002947 | = 1973094 | 333 (1.160) | intergenic (‑113/+45) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase | |||||
Only 100 of 443 total aligned reads displayed.
CTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCTGGATGAATATA > NC_002947/1972945‑1973243 | ttGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGa < 1:5474083‑M2/150‑2 (MQ=255) gcagcaGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaac < 1:2606980‑M2/150‑4 (MQ=255) gTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcc < 2:4204492‑M2/150‑11 (MQ=255) gcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGGGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAggg < 1:6224182/150‑1 (MQ=255) cggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGc < 1:6858944/150‑1 (MQ=255) gtAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTg < 1:496902/150‑1 (MQ=255) tCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCg > 2:2651838/1‑150 (MQ=255) cGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCgg < 2:2959093/150‑1 (MQ=255) aaCATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTc < 2:4674035/150‑1 (MQ=255) ggTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATAAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTAGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTTCCCGGTAATCgg > 1:872456/1‑150 (MQ=255) gTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctc < 2:2309170‑M2/121‑10 (MQ=255) ttCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTc > 1:162155/1‑150 (MQ=255) tCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCt < 1:7040721/150‑1 (MQ=255) tCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAATGCGTCCGAGCCGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCt < 1:1424061/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTgg < 2:2320031/150‑1 (MQ=255) gTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTggg < 1:6480453/150‑1 (MQ=255) gTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTggg > 1:2725600/1‑150 (MQ=255) gTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTggg < 2:5042397/150‑1 (MQ=255) 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ccAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCAccc > 2:450768/1‑150 (MQ=255) aGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTc < 2:5213647/77‑1 (MQ=255) tCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGttgttg < 1:3218492/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTggg < 2:1147605/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTggg > 1:210469/1‑150 (MQ=255) gggCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTgggg < 1:4204492/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCGCCCCAGTTGTTGGGGtt < 2:2063811/150‑1 (MQ=255) ggCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTc < 2:3991274/150‑1 (MQ=255) gcATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCAcc > 2:6735238/1‑65 (MQ=255) gcATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCctc > 2:1895661/1‑150 (MQ=255) gcATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCctc > 1:3895608/1‑150 (MQ=255) cATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCctct < 2:4982892/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCTg < 2:1222406/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCTg > 1:2447255/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCTGGa < 2:6839966/150‑1 (MQ=255) | CTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCTGGATGAATATA > NC_002947/1972945‑1973243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |