New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4778298 = | 326 (1.030) | 18 (0.060) | 10/262 | NT | 5.5% | coding (5963/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4778343 = | 310 (1.010) | coding (5918/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
Only 100 of 393 total aligned reads displayed.
GCACCATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCA > NC_002947/4778149‑4778447 | gtgcccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaa > 1:4311787‑M1/150‑150 (MQ=255) gtgcccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaa > 1:6435446‑M1/150‑150 (MQ=255) gtgcccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaa > 2:5105525‑M1/150‑150 (MQ=255) gtgcccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaa > 2:4219808‑M1/150‑150 (MQ=255) gtgcccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaa > 2:4411219‑M1/150‑150 (MQ=255) gcccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGc < 1:1506976‑M1/3‑1 (MQ=255) ccATGGACTCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGGTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACCTAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGca < 2:1329873/150‑1 (MQ=255) aTGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCCTCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcacc > 2:4312927/1‑150 (MQ=255) aTGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcacc < 2:1410770/150‑1 (MQ=255) tGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcacca < 2:6594771/150‑1 (MQ=255) tGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcacca > 1:285966/1‑150 (MQ=255) tGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCCGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcacca > 1:4582430/1‑150 (MQ=255) gTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCCGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGcaccac < 2:2370862/150‑1 (MQ=255) aaTCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTg > 1:7010046/1‑150 (MQ=255) aaTCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTg > 2:3066797/1‑150 (MQ=255) aTCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGc < 2:3684799/150‑1 (MQ=255) tCGGGCAAGCCCTGACCGAGGACATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCGCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGcc > 2:2602791/1‑150 (MQ=255) gggCAAGCCCTGACCGATGTAATGAGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTc < 2:3884301/150‑1 (MQ=255) 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ccaccaGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGa > 1:3575018/1‑150 (MQ=255) ccaccaGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGa > 1:5019941/1‑150 (MQ=255) cccgTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCTCCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATCCGCCCGGCGTAATCGATca < 2:6726654/147‑1 (MQ=255) caGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATcac > 1:1833896/1‑150 (MQ=255) caGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATcac > 1:2381230/1‑150 (MQ=255) caGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATcac > 1:5738711/1‑150 (MQ=255) aGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATcaca < 2:4746539/150‑1 (MQ=255) cttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTGATCGATCACACCGTc > 1:4632907/1‑150 (MQ=255) cttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTc > 1:6671703/1‑150 (MQ=255) ttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTcc > 1:192119/1‑150 (MQ=255) ttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTcc > 1:4540641/1‑150 (MQ=255) gcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCgg > 1:615066/1‑150 (MQ=255) gggCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGAtcg > 1:6258006/1‑148 (MQ=255) gggCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAg > 2:93208/1‑150 (MQ=255) gggCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAg < 2:7410452/150‑1 (MQ=255) gggCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAg > 1:4373478/1‑150 (MQ=255) gggCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAg > 2:2035120/1‑150 (MQ=255) ccGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCACGCGCACATGGGCGCGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGAAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAgcgc > 1:3429370/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAgcgcgc > 1:1035765/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGAGAGCGCGcc > 1:4031999/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCa < 1:2232378/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCa < 1:968422/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAg > 1:5589682/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAg < 2:2781271/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTc < 2:6375101/150‑1 (MQ=255) cAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGcc > 2:6137672/1‑150 (MQ=255) AGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCa < 2:677672‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCACCATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCA > NC_002947/4778149‑4778447 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |