| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4778298 = | 326 (1.030) | 18 (0.060) | 10/262 | NT | 5.5% | coding (5963/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
| ? | NC_002947 | 4778343 = | 310 (1.010) | coding (5918/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
Only 100 of 423 total aligned reads displayed.
GCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCACG > NC_002947/4778194‑4778492 | gcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTc > 1:5710580‑M1/104‑150 (MQ=255) gcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTc > 1:6896165‑M1/104‑150 (MQ=255) cTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTc < 1:459289/150‑1 (MQ=255) tCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCg > 2:4124063/1‑150 (MQ=255) acctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt > 2:2896547‑M1/101‑150 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCCTCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt > 2:6282860/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt > 1:1896702/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt < 1:1936551/150‑1 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt > 2:3023506/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGGGCGTCGAt > 1:3245332/1‑150 (MQ=255) gCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAtct < 1:2770505/150‑1 (MQ=255) tCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCAcc < 1:3074286/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCt < 1:884633/150‑1 (MQ=255) gCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATa < 2:2312164/150‑1 (MQ=255) cccGGCTCGGCCTACTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCcg < 1:4168355/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAAttttt < 1:5940445/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTAc < 1:6640636/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTAc < 2:5174159/150‑1 (MQ=255) 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gCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTAc > 1:7000182/1‑150 (MQ=255) ccTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACa > 2:5415795/1‑150 (MQ=255) tCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAga < 1:2607919/150‑1 (MQ=255) gcgcACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAgacg > 2:6993701/1‑150 (MQ=255) cgcACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAgacga > 2:5386294/1‑150 (MQ=255) gcACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCg < 2:1014215/139‑1 (MQ=255) gcACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCg > 1:1014215/1‑139 (MQ=255) cGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAAtt < 2:2331/56‑1 (MQ=255) tGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCa < 2:2175162/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATc > 2:145839/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATc < 2:6900862/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGc < 1:1384840/77‑1 (MQ=255) tCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCg > 1:787897/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGaa < 1:6552864/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAAc < 2:6426704/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAAc > 1:538183/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAAc < 2:1401317/150‑1 (MQ=255) gtgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCgg < 1:2507534‑M2/145‑1 (MQ=255) ctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCa > 2:2593511‑M2/3‑150 (MQ=255) ctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCa < 2:4835552‑M2/148‑1 (MQ=255) ctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCa > 1:4074324‑M2/3‑150 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCCGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAc > 2:3172619‑M2/2‑150 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAc < 1:3746276‑M2/149‑1 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAc > 2:4219808‑M2/2‑150 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAc > 2:3245490‑M2/2‑150 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAc > 1:2085236‑M2/2‑150 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGAGCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCCGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGAGCGGGCAc > 2:860556‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGATACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCACG > NC_002947/4778194‑4778492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |