| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 5576407 = | 172 (0.540) | 12 (0.040) | 5/244 | NT | 6.9% | intergenic (+29/+112) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein |
| ? | NC_002947 | 5576492 = | 172 (0.600) | intergenic (+114/+27) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein | |||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
GTTGGGCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCC > NC_002947/5576258‑5576556 | gTTGGGCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTT > 1:5711525‑M1/1‑150 (MQ=255)gTTGGGCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTT > 1:2619682‑M1/1‑150 (MQ=255) tGGGCACTGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGT < 2:4288129‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGGCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGT < 1:4293988‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGGCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGT < 2:731767‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGGCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGT < 1:3709343‑M1/150‑1 (MQ=255) gggCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTG < 2:1934722‑M1/150‑1 (MQ=255) gCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGG > 1:6576810‑M1/1‑150 (MQ=255) gCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGCGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGG > 2:4110417‑M1/1‑150 (MQ=255) tttcaaggtgccggcagaacaggcgatgttgctcacactgtttggcggcttcctggtgcgcctgttggcaatccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccatg < 1:6892008‑M1/2‑1 (MQ=255) cAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGA < 1:6294381‑M1/150‑1 (MQ=255) cAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGA > 1:996085‑M1/1‑150 (MQ=255) cAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGA < 2:6636363‑M1/150‑1 (MQ=255) ttcaaggtgccggcagaacaggcgatgttgctcacactgtttggtggcttcctggtgcgcctgttggcaatccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccatgt < 1:5132803‑M1/3‑1 (MQ=255) ttcaaggtgccggcagaacaggcgatgttgctcacactgtttggtggcttcctggtgcgcctgttggcaatccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccatgt < 1:1395796‑M1/3‑1 (MQ=255) tcaaggtgccggcagaacaggcgatgttgctcacactgtttggcggcttcctggtgcgcctgttggcaatccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccatgtg > 2:933140‑M1/147‑150 (MQ=255) caaggtgccggcagaacaggcgatgttgctcacactgtttggcggcttcctggtgcgcctgttggcaatccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccaTGTgg > 1:5057320‑M1/146‑150 (MQ=255) aggtgccggcagaacaggcgatgttgctcacactgtttggcggcttcctggtgcgcctgttggcaatccgcttccactgggaaatgcccaagttccactacaacgaccagcagtgacgcaatttacaagcgcaacatggcccaTGTGGGa > 1:2938700‑M1/144‑150 (MQ=255) 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gAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCAcgcccgctc < 1:3175205‑M2/150‑10 (MQ=255) gtgGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAt > 1:3354950/1‑150 (MQ=255) ggAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATgg > 1:2793721/1‑150 (MQ=255) acatggagcTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGc > 2:378791/8‑150 (MQ=255) gTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACGCAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGcc > 2:4657060/1‑150 (MQ=255) 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aGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTTCGCTTGTAAAtttag > 1:3979809/1‑147 (MQ=255) aaTAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAAt < 2:5816988/75‑1 (MQ=255) aaTAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCAct > 1:4862813/1‑150 (MQ=255) aaTAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCAct > 2:5132803/1‑150 (MQ=255) tAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCGCATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCActgc > 2:2238886/1‑150 (MQ=255) gCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTg < 2:7233313/150‑1 (MQ=255) cTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa > 2:876995/1‑150 (MQ=255) cAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGt < 2:5203069/150‑1 (MQ=255) cAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGt < 1:4129615/150‑1 (MQ=255) gagCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTgg < 1:3001669/150‑1 (MQ=255) agCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGa < 2:3898562/150‑1 (MQ=255) aTGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACCGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACt > 1:845526/1‑150 (MQ=255) aTGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACt > 2:2657658/1‑150 (MQ=255) cgc‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCATGGGCCAAGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTgg > 1:4563502/1‑150 (MQ=255) cgc‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTgg < 2:2619682/150‑1 (MQ=255) gc‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTggg > 2:5974184/1‑150 (MQ=255) c‑‑cAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGc > 2:5359630/1‑150 (MQ=255) cAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCACCACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCa > 1:771707/1‑150 (MQ=255) cAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTgg < 1:5839405/147‑1 (MQ=255) t‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGACCTTGGGCAtt > 2:3661107/1‑150 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTcc < 2:5711525/150‑1 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTccc > 1:1533196‑M1/1‑150 (MQ=255) | GTTGGGCAATGCGCCCTCCACGATTCCGGTGATCGAGGCGCTGAAGGCCAGGCGTGACGATGAATCGGAATTGGTGCGCGAGCATGTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGC‑‑CAT‑‑‑CCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCC > NC_002947/5576258‑5576556 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |