| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5576407 = | 172 (0.540) | 12 (0.040) | 5/244 | NT | 6.9% | intergenic (+29/+112) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein |
| ? | NC_002947 | 5576492 = | 172 (0.600) | intergenic (+114/+27) | queG/yicG | epoxyqueuosine reductase/inner membrane protein | |||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
GTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGAAATA > NC_002947/5576343‑5576641 | gtgGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAt > 1:3354950/1‑150 (MQ=255) ggAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATgg > 1:2793721/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATg > 2:2831240/1‑150 (MQ=255) ggCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTgcgc > 2:1614392/1‑150 (MQ=255) ggCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTgcgc < 1:7370504/150‑1 (MQ=255) gCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCt > 2:308900/1‑150 (MQ=255) ggAGCTCAATAGCGACCAGCCCCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTg > 2:1943436/1‑150 (MQ=255) aaTAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCAct > 2:5132803/1‑150 (MQ=255) aaTAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCAct > 1:6407444/1‑150 (MQ=255) tAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCGCATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCActgc > 2:2238886/1‑150 (MQ=255) cGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCTTATCAGTCAACACAGGTAATGGAACAGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGTGCCATGTTGCGCTTTTAAATTTCGTCACTGCTgg < 2:3688462/150‑1 (MQ=37) gCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTg < 2:7233313/150‑1 (MQ=255) cTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACCGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa < 1:1362438/150‑1 (MQ=255) cTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa > 2:876995/1‑150 (MQ=255) cTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTa > 2:6892008/1‑150 (MQ=255) tCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAg < 2:1529614/150‑1 (MQ=255) cAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGt < 2:5203069/150‑1 (MQ=255) gagCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTgg < 1:3001669/150‑1 (MQ=255) 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ttCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGa < 1:714409/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCa > 2:140394/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGa > 2:5554488/1‑146 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCaa < 1:308900/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACGTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACAt > 2:526377/1‑150 (MQ=255) tgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATc > 1:369129/1‑150 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTg > 2:54349/1‑150 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCt < 2:7164240/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGc < 1:2358255/150‑1 (MQ=255) cgcccgctcccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGcc < 1:378791‑M2/136‑1 (MQ=255) gcccgctcccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAg > 2:6606164‑M2/14‑59 (MQ=255) gcccgctcccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCg > 2:42648‑M2/14‑150 (MQ=255) gcccgctcccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCg < 1:4132607‑M2/137‑1 (MQ=255) gcccgctcccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCCGTTCTGCCg > 2:3823372‑M2/14‑150 (MQ=255) cccgctcctacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCgg > 2:7319695‑M2/13‑150 (MQ=255) ccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTg > 1:5057320‑M2/6‑150 (MQ=255) ccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTg < 1:2831240‑M2/145‑1 (MQ=255) ccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTg > 1:411159‑M2/6‑150 (MQ=255) ccacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTg > 2:5797007‑M2/6‑150 (MQ=255) cacaTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGAGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGa > 2:2422211‑M2/5‑150 (MQ=255) caTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGaaa < 1:6892008‑M2/148‑1 (MQ=255) caTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGaaa < 2:2741905‑M2/148‑1 (MQ=255) caTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGaaa < 1:2591112‑M2/148‑1 (MQ=255) aTGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGAAAt > 1:7430966‑M2/2‑150 (MQ=255) tGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGAAATa > 1:5405878/1‑150 (MQ=255) | GTGGAGTGGGCGCTGGCCCGTCACGGAGCTCAATAGCGACCAGCCTCAGAGCATGCGCCATCCTTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGCAGGCAACACAGGGAATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGGGCCATGTTGCGCTTGTAAATTGCGTCACTGCTGGTCGTTGTAGTGGAACTTGGGCATTTCCCAGTGGAAGCGGATTGCCAACAGGCGCACCAGGAAGCCGCCAAACAGTGTGAGCAACATCGCCTGTTCTGCCGGCACCTTGAAATA > NC_002947/5576343‑5576641 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |