| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_002947 | 5,701,573 | Δ61 bp | 9.8% | intergenic (+20/‑132) | pyrC' → / → hslV | dihydroorotase‑like protein/ATP‑dependent HslVU protease peptidase subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5701572 | 248 (0.780) | 18 (0.060) | 9/256 | NT | 9.8% | intergenic (+19/‑193) | pyrC'/hslV | dihydroorotase‑like protein/ATP‑dependent HslVU protease peptidase subunit |
| ? | NC_002947 | 5701634 = | 97 (0.320) | intergenic (+81/‑131) | pyrC'/hslV | dihydroorotase‑like protein/ATP‑dependent HslVU protease peptidase subunit | |||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
CCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGA > NC_002947/5701425‑5701720 | cGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGc > 1:6620690/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGc > 2:1484865/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGc < 1:3232583/150‑1 (MQ=255) cGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGc < 2:3164721/150‑1 (MQ=255) gCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGcc < 1:5935516/150‑1 (MQ=255) cGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTc < 1:3194486/150‑1 (MQ=255) gTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGGCGGGCGCGGTGCGCTAGCCCTCGGTCGATGGCCACATCTGCCACGATTCCTGAGTCCCATGGGTAGCGGGCAtgcccgcgaa < 2:2451078‑M1/150‑11 (MQ=255) gTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCGtgcccgctaa < 2:650090‑M1/150‑11 (MQ=255) 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aCCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCcaca < 1:543553/150‑1 (MQ=255) aCCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCcaca < 2:2277892/150‑1 (MQ=255) aCCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCcaca < 2:2099057/150‑1 (MQ=255) aCCGGTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCcaca < 2:485104/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCAtgcccgcgaatgcct < 2:7431354‑M1/150‑16 (MQ=255) 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ggCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTcac < 2:3968274/150‑1 (MQ=255) tGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCGTCACAGAGTcc > 1:2388650/1‑150 (MQ=255) taCCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGcc < 1:3454606/150‑1 (MQ=255) aCCTTTGTCGATGTCCACATTTGCAAGGATGGCTGTTTACCATTGTTAGCGGGCAtgcccgcgaatgccttcacatagtccccccgccaagcgcgaccattcatcccccccggttgaaatccttccccccacccccatatgagtctgcat < 1:6739738‑M1/150‑96 (MQ=255) ccTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCaa < 2:6620690/150‑1 (MQ=255) ttGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCCTGCCCGCGAATGCCTTCGCCTAGTCGCCCCGcggggc > 2:5323115/1‑145 (MQ=39) ccgtcGATCGCCCCATGTGCCAGGCGGCCTGAGTCCCATGCTTAGCGGGCAtgcccgcgaatgccttcacatagtccccccgccaatcgcgacctttcatcccccccggttgaaatccttccccccacccccatatgagtctgcatccgg < 2:4324421‑M1/148‑100 (MQ=255) ggTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAgcgc < 1:4424484/150‑1 (MQ=255) tCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGa < 1:5302635/150‑1 (MQ=255) aGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCtt < 1:1484865/150‑1 (MQ=255) gTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCCCCACACTTCCCAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTc < 2:6020713/150‑1 (MQ=255) aCCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTccc < 1:405034/150‑1 (MQ=255) ctAGCGGGCCCGCCCGCTCCCACCCGATCCCCCCACTGCCAAGGCA‑TGCGGTAACCCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACCCAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCACTCAACCCCCCCGGCTGAAATCCTCcccccccccc < 2:2674934/149‑1 (MQ=255) gCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCcccccaccccca < 1:3410256/150‑1 (MQ=255) ggCTCGCACGCTCCCTCTGGATGCCCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTATCCCTTTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCatat < 1:1641428/150‑1 (MQ=255) gCAtgcccgcgaatgccttcacatagtccccccgccaagcgcgaccattcatcccccccggttgaaatccttccccccacccccatatgagtctgcatcaggcactttcgccccgctgcgtggagactctccccttgaccacaatcgttt < 1:2565594‑M1/150‑148 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGa < 1:153683/150‑1 (MQ=255) | CCGCAAGCGTCCACCGTTGCTGGCGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGA > NC_002947/5701425‑5701720 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |