| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 4865665 = | 305 (1.000) | coding (379/2331 nt) | ligA | DNA ligase | |||||
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
GCTCATGTACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGCCCAGGCTGAGCATGG > NC_002947/4865516‑4865814 | gCTCATGTTCACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGcc > 2:5269718/1‑150 (MQ=255)gCTCATGTACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGcc > 1:6071484/1‑150 (MQ=255)gCTCATGTACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGcc < 1:3009713/150‑1 (MQ=255) tCATGTACAGCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGGGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGt > 2:6728646/1‑150 (MQ=255) tCATGTACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGt > 2:1981617/1‑150 (MQ=255) tCATGTACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGt > 1:2067044/1‑150 (MQ=255) tGTACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTcgc > 2:1201787/1‑150 (MQ=255) gTACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTcgcg > 2:570369/1‑150 (MQ=255) tACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCgg < 1:4494335/150‑1 (MQ=255) acacCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGt > 2:6015542/1‑150 (MQ=255) gtcgcgtggtagaaggcctcgatcagccgggcgcggtcgactacagctgcgaacccaagctcgatggcctggccgtgagcctgctgtaccgcgacggccagtggtgccgtcgccacgggtggcgccctgcaccagctggcCGTCGCGGTa < 1:618594‑M2/10‑1 (MQ=255) acCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTAc > 2:3224347/1‑150 (MQ=255) acCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTAc > 1:3781907/1‑150 (MQ=255) cTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTAcag > 2:6400892/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTAcagc > 2:2631603/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTAcagc > 1:673360/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTAcagc > 2:5548167/1‑150 (MQ=255) ccgcGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAgg > 2:2324593/1‑150 (MQ=255) 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aGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTAGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTgg < 1:1112405/150‑1 (MQ=255) ttACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCg > 2:6383167/1‑150 (MQ=255) tACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGc > 1:4010899/1‑150 (MQ=255) aCCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCa < 1:4233005/150‑1 (MQ=255) cccTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAg > 1:100999/1‑150 (MQ=255) 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agggcGCCACCCGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCg > 2:3429793/5‑150 (MQ=255) gTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGc < 2:1545915/150‑1 (MQ=255) gTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGc < 1:4914566/150‑1 (MQ=255) cACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGcttctt < 1:3658610/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCttcttc < 2:3602796/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCg < 2:787157/150‑1 (MQ=255) gggTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGa < 1:1559344/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGaa < 1:6016075/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGaa < 2:5315314/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGaa < 1:1683126/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGaa < 2:2131204/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGaa > 1:5353352/1‑150 (MQ=255) ccgtggcgacggcaccagctggcCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGaa > 1:640904‑M2/24‑150 (MQ=255) gcgcCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCg > 1:5712783/1‑150 (MQ=255) gcCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGtt > 2:280969/1‑150 (MQ=255) cccTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTg < 1:2332133/150‑1 (MQ=255) cccTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTg > 2:5505879/1‑150 (MQ=255) cTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGcc > 1:5172893/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGCCCa < 1:679314/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGCCCAgg < 2:4132940/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCAAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGCCCAGGCt < 2:1342296/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGCCCAGGCTGa < 1:4154611/150‑1 (MQ=255) ctggcCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGCCCAGGCTGAg > 1:1383526‑M2/6‑150 (MQ=255) gcCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGCCCAGGCTGAGcag > 2:2415531‑M2/3‑149 (MQ=255) | GCTCATGTACACCTCGCCGCGCACCTCCAGCACTGCCGGCCAGCCCTTACCCTGCAACTTGAGCGGGATGTTGCGCACGGTGCGTACGTTGGCGCTGATGTCTTCGCCAGTGGTGCCGTCGCCACGGGTGGCGCCCTGCACCAGCTGGCCGTCGCGGTACAGCAGGCTCACGGCCAGGCCATCGAGCTTGGGTTCGCAGCTGTAGTCGACCGCGCCCGGCTGATCGAGGCCTTCTACCACGCGACGGCCGAACTCACGCAGGTCGGCTTCTTCGAAGGCGTTGCCCAGGCTGAGCATGG > NC_002947/4865516‑4865814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |