Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_002947 | 1,515,811 | (33-bp)2→1 | pseudogene (715‑747/1851 nt) | PP_1325 ← | putative lipoprotein |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 1515768 | 0 (0.000) | pseudogene (790/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
CAGCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCG‑‑GGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGC > NC_002947/1515619‑1515916 | cAGCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCG‑‑GGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGAt < 2:3513215/150‑1 (MQ=255) gCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCG‑‑GGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATct < 2:354793‑M2/150‑3 (MQ=255) gAGCCGCTGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCG‑‑GGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttg > 1:3923483‑M2/1‑146 (MQ=255) 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1:5498264‑M2/1‑55 (MQ=255) gcgcG‑‑GGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcg < 1:1059944‑M2/150‑101 (MQ=255) cgcg‑‑GGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcga < 1:1715645‑M2/150‑102 (MQ=255) gcg‑‑GGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgat > 2:4774462‑M2/1‑48 (MQ=255) cacCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgctt < 1:2683363‑M2/150‑111 (MQ=255) cacCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgctt < 1:4943819‑M2/150‑111 (MQ=255) acCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg < 2:421368‑M2/150‑112 (MQ=255) acCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgctt > 1:1094843‑M2/1‑39 (MQ=255) ccGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgc > 2:655033‑M2/1‑38 (MQ=255) cGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgct < 1:1459396‑M2/150‑114 (MQ=255) ggCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctg < 1:2805913‑M2/150‑115 (MQ=255) gCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgc > 2:2970057‑M2/1‑35 (MQ=255) ccAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgct > 1:4722544‑M2/1‑34 (MQ=255) cAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctg < 2:5197947‑M2/150‑118 (MQ=255) aGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttc > 2:2018146‑M2/1‑32 (MQ=255) ccTTCCAGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagg > 1:3014047‑M2/1‑26 (MQ=255) ttCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggt > 1:1049249‑M2/1‑24 (MQ=255) ccTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgc > 2:5344821‑M2/1‑22 (MQ=255) tGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccg < 2:5871308‑M2/150‑131 (MQ=255) cagcagcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgct < 2:5168197‑M2/150‑136 (MQ=255) agcagcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgctt > 1:4213383‑M2/1‑14 (MQ=255) agcagcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgaccc > 1:579041‑M2/1‑14 (MQ=255) cagcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgctttt > 1:2031925‑M2/1‑12 (MQ=255) agcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttc < 1:1242562‑M2/150‑140 (MQ=255) agGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttcacg < 2:4475234‑M2/150‑143 (MQ=255) gggCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttcacgg > 2:4332051‑M2/1‑7 (MQ=255) aTcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttcacggcgaag > 2:2142403‑M2/1‑2 (MQ=255) | CAGCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCG‑‑GGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGC > NC_002947/1515619‑1515916 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |