New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4934781 = | 228 (0.940) | 13 (0.060) | 7/252 | NT | 6.0% | coding (385/2244 nt) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
? | NC_002947 | 4934861 = | 195 (0.880) | coding (305/2244 nt) | cheA | chemotaxis histidine kinase CheA |
TCCTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4934939‑4934781 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctggccgaacATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGGCGCCCC > NC_002947/4934861‑4935008 TCCTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCC < 1:872747/150‑1 TCCTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGACCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCC < 1:5252993/150‑1 CCTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCT < 2:853229/150‑1 CTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTG < 1:1519878/150‑1 CTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTG < 1:691556/150‑1 CTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTG > 2:5143985/1‑150 CTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTG < 1:1519877/150‑1 CTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTG < 1:1859155/150‑1 TGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGG > 1:1195181/1‑150 GCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGC < 1:5204688/150‑1 GCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGC < 2:1994878/150‑1 CGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCC < 2:2241507/150‑1 CGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCC < 1:3953033/150‑1 GCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCG > 1:321177/1‑150 GCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCG > 1:321274/1‑150 GCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCG > 1:322279/1‑150 CAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGA > 1:3078423/1‑150 AAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAA < 2:750044/150‑1 AAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAA < 2:749939/150‑1 AAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAA > 2:3865924/1‑150 AAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAA > 2:1821122/1‑150 AAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAAC < 2:2977646/150‑1 AAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAAC < 2:2977205/150‑1 TCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATC > 1:391812/1‑150 TCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATC > 1:3157394/1‑150 CCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCA > 1:1155227/1‑150 CCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCA > 1:2620803/1‑150 CCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCA > 1:2620950/1‑150 CCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCAC < 1:1743101/106‑1 CCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCAC > 2:1743101/1‑106 CAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAG > 2:2666159/1‑150 CAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAG > 1:4591346/1‑150 GTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGAC > 1:2393657/1‑150 GTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGAC > 1:2393730/1‑150 GAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAACCTGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTC > 2:2518219/1‑150 GTCGCGCCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAA < 2:391812/150‑1 CCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGC < 1:626428/150‑1 CCTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGC < 1:3438149/150‑1 CTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCC > 1:501142/1‑150 CTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCC > 1:4888748/1‑150 CTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCC > 1:3399488/1‑150 CTGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCC > 2:2576837/1‑150 TGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCG < 2:2088103/150‑1 TGGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCG < 2:1245749/150‑1 GGCCGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGG < 2:5535407/150‑1 CGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGGCGC > 1:1429553/1‑150 CGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGGCGC > 2:5595784/1‑150 CGAACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGGCGC > 2:5595966/1‑150 AACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGGCGCCC > 1:3430726/1‑150 AACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGGCGCCC > 1:619269/1‑150 ACATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGGCGCCCC < 2:796445/150‑1 TCCTGCGCAAAGGTGAGCGCCGGGTCGATGCGGAACTGATGGATGTGGTGCTCGAGGCACTGGATACGGTCAACAGCATGTTCGGCCAGGTGCGCGAGCGTGCCGAAGTGACACCGGCCACCCCGGCGCTGCTGGCAGCGCTGTCGCGCCTGGCCGAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4934939‑4934781 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctggccgaacATGCTGTTGACCGTATCCAGTGCCTCGAGCACCACATCCATCAGTTCCGCATCGACCCGGCGCTCACCTTTGCGCAGGACGTCGAACACGTTCTCGGCGATATGGCAGCACTCCACCAGCTCGTTCAGCTGAAGGAAGCCGGCGCCCC > NC_002947/4934861‑4935008 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |