| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5243658 | 200 (0.830) | 12 (0.050) | 8/256 | NT | 5.6% | coding (173/204 nt) | PP_5701 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5243723 | 216 (0.960) | intergenic (+34/‑247) | PP_5701/PP_4616 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
TTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5243501‑5243658‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTTCCGGCACGTTAACCAGCCTTAGTGCGAAGTTCCTGGGCTCAGCGGACATCTGCACCTGAAC < NC_002947/5243723‑5243576 aTGCCTCAAGGTGCCTTGCGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCT > 2:2804034/2‑150aTGCCTCAAGGTGCCTTGCGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCT > 2:1744688/2‑150 GCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTC < 1:1540022/150‑1 GCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTC < 1:355603/150‑1 GCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGGCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTC < 1:3863859/150‑1 CCGCTAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCG > 2:1062980/1‑150 CCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCG > 2:4065896/1‑150 CCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTCCG < 1:3838660/150‑1 CGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGTCCGGCCCTTTCGC > 2:1012570/1‑150 CGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGC > 1:384929/1‑150 CGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGC > 1:384737/1‑150 GCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCG < 1:1133584/150‑1 GCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCG < 2:147493/150‑1 GCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCG > 1:3249237/1‑150 GCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCG > 1:3249444/1‑150 GCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCG < 1:1188371/150‑1 CAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGG < 2:4157768/150‑1 AAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGG < 1:1416108/150‑1 AGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGTCGGCAGGTCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTC < 1:1971349/150‑1 GGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCGAGCCCGCgaa < 2:5624183/150‑4 CATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCGAGCCCGCgaaga < 1:591907/150‑6 TGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGTCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA < 1:1012570/150‑1 CCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGA < 1:2021501/150‑1 TCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAG < 1:22522/150‑1 gggggCAGGTGCCGATGTCCGCTGAGCCCAGGACCTTCGCACGAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGA < 2:1656733/145‑1 TGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCCGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGA < 1:3149101/150‑1 TTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCC < 1:27598/150‑1 CAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGA < 2:624004/150‑1 CAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGA < 2:4147289/150‑1 GCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGTCCGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTTCCG < 2:2075911/150‑1 cctgTCGGGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTTCCGGCACGTTAACCAGCCTTAGTGCGAAGTTCCTGGGCTCAGCGGACATCT < 1:4875747/146‑1 TCGCGGCCACGCCCGCTCCCACACGTACTCAGCAACACTTGACTACTGTGGTCACCCCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTTCCGGCACGTTAACCAGCCTTAGTGCGAAGTTCCTGCGCTCAGCGGACATCTGCAC < 2:5005841/150‑1 GGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTTCCGGCACGTTAACCAGCCTTAGTGCGAAGTTCCTGGGCTCAGCGGACATCTGCACCTGA > 2:1513253/1‑150 GCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTTCCGGCACGTTAACCAGCCTTAGTGCGAAGTTCCTGGGCTCAGCGGACATCTGCACCTGAAC > 1:2718571/1‑150 TTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5243501‑5243658‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTTCCGGCACGTTAACCAGCCTTAGTGCGAAGTTCCTGGGCTCAGCGGACATCTGCACCTGAAC < NC_002947/5243723‑5243576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |