New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
GCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTCGCGGGCAAGCCTGTG > NC_002947/5243511‑5243807 | gCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTc > 1:4356588/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGcc < 2:4926988/150‑1 (MQ=255) cTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGccc > 2:3324014/1‑150 (MQ=255) 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cATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCca < 2:1879909/150‑1 (MQ=255) aTGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCcac > 2:2266186/1‑150 (MQ=255) aTGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCcac > 1:5090705/1‑150 (MQ=255) tGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGTCCGGCCCTTTCGCGGGCacgcccgctcccaca < 1:1012570‑M1/150‑16 (MQ=255) gCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCGCCCACAGc > 1:575375/1‑150 (MQ=255) 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ccGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAgccgc > 2:1706127/1‑150 (MQ=255) cGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTgcccgcgaaagggccggaccttccggcacgttaaccagccttagtgcgaagttcctgggc < 2:2075911‑M2/150‑61 (MQ=255) ggAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGGCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCGCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCa > 2:1396869/1‑150 (MQ=255) gacGGGCCGGCCTCGTCGCGGGCTCGCCGGCTCCCCCAGCGGTCACCACCGGAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCAc > 1:4195876‑M1/4‑150 (MQ=255) gAAGGGCCGGCCGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACCGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCAc < 1:3940384/150‑1 (MQ=255) 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ctctTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTCGCgg < 2:1193896/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTgcccgcgaagaggccggcccttccggcacgttaaccagccttagtgcgaagttcctgggctcagcggacatctg < 2:624004‑M2/150‑75 (MQ=255) ctTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTCGCGGGc > 2:3633951/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCAGTCGCGGGcc > 1:3667748/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGATCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCAAAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCAGCGAAAGGGCCGGACCATCCGACAAATATCCCCGGCCAAGCAACGTAGCAGCCGCCACACCATTCGAGGGCa > 1:838364/1‑150 (MQ=37) gagcgGGCGAGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTCGCGGGCaa > 2:5624482/3‑150 (MQ=255) gggggCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACTGTAGTAAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGTACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTCGCGGGCAAGc < 1:3938564/148‑1 (MQ=255) cgGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACGGCCGGGCCAGCCGACAAAAAACCCCGGCCATGCACCCGCGCAGCCGCCACCCCAATCGCGGGCAAGcc > 1:2504033/1‑150 (MQ=37) gggCacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagaggccggcccttccggcacgttaaccagccttagtgcgaagttcctgggctcagcggacatctgcacctga > 2:1513253‑M1/1‑4 (MQ=255) gCTCGCCCGCTCCCACCGCGGTCACCACAGTCGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTCGCGGGCAAGCCtgt < 1:1412860/150‑1 (MQ=255) gCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTCGCGGGCAAGCCtgt < 1:2728132/150‑1 (MQ=255) | GCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCATTCGCGGGCAAGCCTGTG > NC_002947/5243511‑5243807 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |