| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1337382 | 240 (0.990) | 9 (0.050) +AGGCCGGCGCCGTCTTTTTGCCGGCGCGGCCTGGTGC |
7/200 | NT | 5.1% | intergenic (+8/‑1248) | PP_1157/PP_1159 | acetolactate synthase/membrane protein |
| ? | NC_002947 | 3812946 = | 215 (0.890) | intergenic (+26/+101) | PP_3364/PP_3365 | two‑component system response regulator/acetolactate synthase | |||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
GGAAAGCGCCGAAGGCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTC > NC_002947/1337233‑1337531 | gAAAGCGCCGAAGGCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACg > 1:96169/1‑150 (MQ=38) gAAAGCGCCGAAGGCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACg > 2:82736/1‑150 (MQ=38) aaGCGCCGAAGGCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGAc < 2:2294232/150‑1 (MQ=39) aaGCGCCGAAGGCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGAc < 2:3880410/150‑1 (MQ=39) gcCGAAGGCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTa < 1:3874529/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCa < 1:1004854/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCa < 1:1004828/148‑1 (MQ=255) ctgctgCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACCGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTaa < 2:217956/150‑1 (MQ=255) ctgcCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGcc < 1:5547733/150‑1 (MQ=255) ctgcCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGcc > 1:3189098/1‑150 (MQ=255) tgcCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCg < 1:3774641/150‑1 (MQ=255) tgcCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCg < 2:191316/150‑1 (MQ=255) tgctgGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTGACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCAccc > 1:1705442/1‑150 (MQ=255) gctgGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCca < 1:1278706/150‑1 (MQ=255) gctgGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCca < 1:3642109/150‑1 (MQ=255) ggAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAg < 1:2001205/150‑1 (MQ=255) ggAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAg < 2:1741142/150‑1 (MQ=255) cTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATca > 2:605336/1‑150 (MQ=255) tGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATcac > 2:2812586/1‑150 (MQ=255) tGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATcac > 1:2650379/1‑150 (MQ=255) aTCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTa < 2:4371241/143‑1 (MQ=255) aTCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACg > 2:3159798/1‑150 (MQ=255) aTCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACg > 2:1286358/1‑150 (MQ=255) tCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGa > 2:5286172/1‑150 (MQ=255) aaGCCCCCCGGTGTGCACGTGACCGACAGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTCACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATc < 1:2349497/150‑1 (MQ=21) aaGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATc < 1:5014531/150‑1 (MQ=255) aaGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATc < 1:316292/150‑1 (MQ=255) aaGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAAAGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGAAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATc > 2:1509287/1‑150 (MQ=255) aGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATcc < 1:1051431/150‑1 (MQ=255) aCCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTg > 2:1242104/1‑150 (MQ=255) ccccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGt > 2:1009178/1‑150 (MQ=255) cccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTaa > 2:336502/1‑118 (MQ=255) cccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTaa < 1:336502/118‑1 (MQ=255) cccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAg > 1:4882938/1‑132 (MQ=255) cccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTa < 1:1446722/150‑1 (MQ=255) cccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTa < 1:703375/150‑1 (MQ=255) cccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTa < 1:2561610/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAg > 1:426016/1‑150 (MQ=255) cggTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGt < 2:4717590/149‑1 (MQ=255) aGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGt > 2:5373626/1‑150 (MQ=255) tgtgCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGcc > 2:980194/1‑150 (MQ=255) gtgCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCg < 1:317567/150‑1 (MQ=255) tgCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCgg < 1:2857886/150‑1 (MQ=255) tgCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCgg < 2:1162334/150‑1 (MQ=255) 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cGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAAc < 2:5173428/150‑1 (MQ=255) cGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAAc < 2:2331272/150‑1 (MQ=255) ggTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAAcc > 2:3105716/1‑150 (MQ=255) ggTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGGGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAAcc > 2:4901677/1‑150 (MQ=255) tCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCATCCAc < 2:100468/150‑1 (MQ=255) 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tACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCAc < 1:3420090/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCCCTGGCGGTGTAAGCCCTGACaggccggcgccgtctttttgccggcgcggcctggtgctgcaaagaggcccgtaaagccgacacattaccgtcagctatacgggc < 1:2663182‑M1/150‑85 (MQ=255) gCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCct < 2:1386970/150‑1 (MQ=255) agaACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCtt < 1:2909491/150‑1 (MQ=255) agaACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCtt < 1:3997301/150‑1 (MQ=255) agaACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCtt < 1:5445282/150‑1 (MQ=255) aaCGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGc > 1:4095649/1‑150 (MQ=255) aaCGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCCCTGGCGGTGTAAGCCCTGACaggccggcgccgtctttttgccggcgcggcctggtgctgcgaaaaggcccgtaaagccgacacattaccgtcagctatacgggcctctttg < 1:4780082‑M1/150‑92 (MQ=255) cGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCaa < 2:1603687/150‑1 (MQ=255) gACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGc < 2:4251827/74‑1 (MQ=255) gACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAAt > 1:76084/1‑150 (MQ=255) 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tCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCGACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCAt > 1:5286387/1‑150 (MQ=255) cTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCATCCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATtc > 2:869163/1‑150 (MQ=255) tCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATtct > 1:1027023/1‑150 (MQ=255) tCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATtct > 1:1531854/1‑150 (MQ=255) aaCCGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCa < 1:1343491/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCa < 1:4820014/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAg < 1:173408/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAgg < 2:3216942/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATc < 2:5392382/140‑1 (MQ=255) gAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTtct > 1:1859019/1‑150 (MQ=255) gAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTtct < 2:3448619/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTtctc < 2:3737809/150‑1 (MQ=255) tGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTAc > 1:929570/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCa < 2:4765165/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCAt < 1:3030990/150‑1 (MQ=255) gcgcgcgcTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGga < 1:2734760/150‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGaa < 1:5318219/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACga < 2:4192013/150‑1 (MQ=255) ggTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATc > 2:3944524/1‑150 (MQ=255) gtgtAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCa < 1:3472152/150‑1 (MQ=255) gtgtAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCa < 1:4665575/150‑1 (MQ=255) gtAAGGCCTGACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATg < 2:1705442/150‑1 (MQ=255) gtAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATg < 2:518894/150‑1 (MQ=255) tAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTgg > 1:4581115/1‑150 (MQ=255) aCGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGtt > 1:3920001/1‑150 (MQ=255) | GGAAAGCGCCGAAGGCCTGCTGCCGCTGCTGGAGCACTGCATCAAGACCCCAGGTGTGCACGTGATCGACTGCCCGGTCGATTACAGCGAGAACGACCGCATCCTCAACAGCGAGCTGCGTGAGCGCGCGCTGGCGGTGTAAGGCCTAACGACCTTATCGCAGTAAGCCGGCACCCACAGGTATCACACGATCCTGTAGGTGCCGGCAGGTGCTACATAGCAACCACTTCACGCCTCTTGCAATTGATCATTCTCAGGTTCTCTACTCATGGAGAACACGAGATCATGACTATTGGTTC > NC_002947/1337233‑1337531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |