| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGTTGCGTGGATCGTAGCCGGCTTTTTCCAGGTTCTGGATACCGATGCGGTCGGCTTCCTGTTCATTCTGGCGCGAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGCGACA > NC_002947/1416197‑1416495 | gttcctcaacgcccagaccgagggcgaatatgcctcggtactggcccacgaactggcgcacttgtcgcaacgccacttcgcgcggggtgtcgaggcccagcagcgcatgcagttgccgatgatggcggcgctgctggccggcatcgtgct > 1:2687481‑M1/150‑150 (MQ=255) ttcctcaacgcccagaccgagggcgaatatgcctcggtactggcccacgaactggcgcacttgtcgcaacgccacttcgcgcggggtgtcgaggcccagcagcgcatgcagttgccgatgatggcggcgctgctggccggcatcgtgcTg < 2:701859‑M1/2‑1 (MQ=255) ctcaacgcccagaccgagggcgaatatgcctcggtactggcccacgaactggcgcacttgtcgcaacgccacttcgcgcggggtgtcgaggcccagcagcgcatgcagttgccgatgatggcggcgctgctggccggcatcgtgcTGGcc < 2:1916575‑M1/5‑1 (MQ=255) ctcaacgcccagaccgagggcgaatatgcctcggtactggcccacgaactggcgcacttgtcgcaacgccacttcgcgcggggtgtcgaggcccagcagcgcatgcagttgccgatgatggcggcgctgctggccggcatcgtgcTGGcc < 1:467032‑M1/5‑1 (MQ=255) tcaacgcccagaccgagggcgaatatgcctcggtactggcccacgaactggcgcacttgtcgcaacgccacttcgcgcggggtgtcgaggcccagcagcgcatgcagttgccgatgatggcggcgctgctggccggcatcgtgcTGGCCg < 2:2206154‑M1/6‑1 (MQ=255) tcaacgcccagaccgagggcgaatatgcctcggtactggcccacgaactggcgcacttgtcgcaacgccacttcgcgcggggtgtcgaggcccagcagcgcatgcagttgccgatgatggcggcgctgctggccggcatcgtgcTGGCCg < 1:3848905‑M1/6‑1 (MQ=255) tcaacgcccagaccgagggcgaatatgcctcggtactggcccacgaactggcgcacttgtcgcaacgccacttcgcgcggggtgtcgaggcccagcagcgcatgcagttgccgatgatggcggcgctgctggccggcatcgtgcTGGCCg < 1:1980379‑M1/6‑1 (MQ=255) caacgcccagaccgagggcgaatatgcctcggtactggcccacgaactggcgcacttgtcgcaacgccacttcgcgcggggtgtcgaggcccagcagcgcatgcagttgccgatgatggcggcgctgctggccggcatcgtgcTGGCCGc < 1:961930‑M1/7‑1 (MQ=255) 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tCTGGCGCGAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCt < 1:5575723/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCGAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTc > 2:737867/1‑150 (MQ=255) ggCGCGAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGa > 2:5239147/1‑150 (MQ=255) ggCGCGAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGa < 2:5571285/150‑1 (MQ=255) gcgAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGacac > 2:3190413/1‑150 (MQ=255) gcgAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGacac < 1:181652/150‑1 (MQ=255) cgAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACAcc < 2:4737764/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCcgcgc < 1:1750686/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGt < 2:5591327/150‑1 (MQ=255) tCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGaa < 1:5470841/143‑1 (MQ=255) tCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGaa > 2:5470843/1‑143 (MQ=255) tCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGt > 1:3531279/1‑150 (MQ=255) cTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTg > 2:5351450/1‑150 (MQ=255) tGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGc < 2:2050934/150‑1 (MQ=255) tGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGc > 1:1909506/1‑150 (MQ=255) tGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGc < 1:4199047/150‑1 (MQ=255) tGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGc < 2:2009151/150‑1 (MQ=255) gAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCGCGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGCg > 1:2532419/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGTAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGCGa > 2:2610194/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGCTGCCTGGGTGCCGTCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGCGAc < 2:1064513/150‑1 (MQ=255) TGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCCGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGCGACa < 1:2865892‑M1/150‑1 (MQ=255) | CGGTTTGGCGTCATAGCGATACTGGCGTGCCAGGCGCTCGAACATGGTCGGCATGTTGCGTGGATCGTAGCCGGCTTTTTCCAGGTTCTGGATACCGATGCGGTCGGCTTCCTGTTCATTCTGGCGCGAGAAGCGCCGTTGCTCCTGAATGGCCGCTGCCTGGGTGCCGGCAATCATGCCGATGCCCGCATCGCCGGCACCACCTGCGGCCAGCACGATGCCGGCCAGCAGCGCCGCCATCATCGGCAACTGCATGCGCTGCTGGGCCTCGACACCCCGCGCGAAGTGGCGTTGCGACA > NC_002947/1416197‑1416495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |