| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1436670 | 265 (1.100) | 16 (0.070) | 10/262 | NT | 5.6% | coding (158/336 nt) | PP_1253 | ArsR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 1436695 | 286 (1.240) | coding (133/336 nt) | PP_1253 | ArsR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
GCCCGGGAAACCGCTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATT > NC_002947/1436521‑1436818 | cGGGAAACCGCTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGc > 2:48842/1‑150 (MQ=255) gggAAACCGCTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCt > 1:4706189/1‑150 (MQ=255) ggAAACCGCTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTg < 1:4331904/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTc > 1:753848/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCgg > 2:4558705/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCGCGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGc < 2:2171298/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGc > 1:4016069/1‑150 (MQ=255) cGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCa < 1:1466717/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCAc < 1:2126772/150‑1 (MQ=255) ccccGCCTCTCGCTACGCAGCGACTTCATATGGGTAGTCCCCACCTTGCGGGTGTGCACCAGCCCTGCCTCACGCACCACACGGACGTGGTGGGACCTGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACCGCTGGCCTCGGCCCCg > 2:667700/1‑150 (MQ=255) cAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGcc > 1:4544557/1‑150 (MQ=255) aGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCg < 1:2028861/150‑1 (MQ=255) aGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCg < 1:1272127/150‑1 (MQ=255) cATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGc < 2:3208157/150‑1 (MQ=255) aTCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGcc < 2:2480393/150‑1 (MQ=255) tCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGACGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGg < 2:4658490‑M2/150‑2 (MQ=255) aCGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtggcg > 1:1570904‑M2/1‑144 (MQ=255) aCGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtggcg < 1:5610463‑M2/150‑7 (MQ=255) aCGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtggcg > 2:4220488‑M2/1‑144 (MQ=255) gCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACCCGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACctggccggcgtggccgaggccagctgtggcgag < 2:3637613‑M1/150‑34 (MQ=255) aGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACg > 1:4261106/1‑150 (MQ=255) aGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACg > 1:5433481/1‑150 (MQ=255) gAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGAtt > 2:3929718/1‑150 (MQ=255) aaTTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGAttt > 2:207578/1‑150 (MQ=255) ttCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTcc > 1:3703323/1‑150 (MQ=255) tCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCa > 1:3546198/1‑150 (MQ=255) cATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAg < 2:2018304/150‑1 (MQ=255) atatGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAgg > 2:2431662/1‑150 (MQ=255) gatgGGGAGTCCCCACCGTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACACctggccggcgtggccgaggccagctgtggcgagctggatggag < 2:3530901‑M1/149‑44 (MQ=255) gTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCCGCCCTGCATCCCGCAACACACGGACGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACctggccggcgtggccgaggccagctgtggcgagctggatggaggtcggcc < 2:1347868‑M1/150‑51 (MQ=255) gTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACg < 1:3835983/150‑1 (MQ=255) cccACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCg > 1:523596/1‑150 (MQ=255) ccACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGc > 2:2981436/1‑150 (MQ=255) ccACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGc > 2:5524491/1‑150 (MQ=255) cacaTTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCt > 1:4995470/1‑150 (MQ=255) caTTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTTGTGGGACATGCTCGACTTCGGACGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCTGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGTGGTCGCTGa < 2:1440162/150‑1 (MQ=255) ttGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAgc < 2:2762454/150‑1 (MQ=255) gggTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCAt > 1:1735331/1‑150 (MQ=255) 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acacacGGTAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGTTGGGGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATATAGCTGGCGTTCAATTATGAGttcgt < 2:2941659/150‑1 (MQ=255) cacacGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGgtcgtc > 2:824256/1‑150 (MQ=255) acacGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGtcgtcg > 1:4425774/1‑150 (MQ=255) ggAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGt > 1:4902744/1‑150 (MQ=255) ggAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGt < 1:4132187/150‑1 (MQ=255) 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cTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCTGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCt > 1:5501168/1‑150 (MQ=255) tCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTc > 1:2857012/1‑150 (MQ=255) tCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTc < 1:3929718/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATg < 1:1045876/150‑1 (MQ=255) tCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATgg < 2:4396066/150‑1 (MQ=255) ggCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGtt < 2:3802460/150‑1 (MQ=255) gCCGACCTCCACCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTg > 1:984419/1‑150 (MQ=255) ccGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGa < 2:4261106/150‑1 (MQ=255) ccGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGa < 1:4568098/150‑1 (MQ=255) ccTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATg < 2:1746654/150‑1 (MQ=255) tccatccaGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGAt < 2:1398049/150‑1 (MQ=255) atccaGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAAc < 2:3030710/150‑1 (MQ=255) caGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACggg < 2:1304704/150‑1 (MQ=255) aGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACgggg < 2:1096176/150‑1 (MQ=255) cTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGt > 2:3503206/1‑150 (MQ=255) tCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtggcgagctggatggaggtcggccgaagtcgtgcatgtcccaccacttccgggtgttgcgtgatgcagggctggtgcaaacccgcaatgtggggtctacccatatgaattcgctgcg < 1:2174358‑M2/150‑119 (MQ=255) tCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGtt > 2:5311308/1‑150 (MQ=255) gC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTc < 1:5070985/150‑1 (MQ=255) c‑‑cACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCa < 2:2115557/150‑1 (MQ=255) c‑‑cACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCa < 1:207578/150‑1 (MQ=255) cactGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCTCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATACCGGGGGTTTCAt < 2:942960/150‑1 (MQ=255) cacaGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCAt > 2:5099608/1‑150 (MQ=255) acaGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtgtggcgagctggatggaggtcggccgaagtcgagcatgtcccaccacttccgtgtgttgcgtgatgcagggctggtgcaaacccgcaatgtggggactacccatatgaattcgctgcgtag < 1:5160343‑M2/150‑124 (MQ=255) acaGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtgtggcgagctggatggaggtcggccgaagtcgagcatgtcccaccacttccgtgtgttgcgtgatgcagggctggtgcaaacccgcaatgtggggactacccatatgaattcgctgcgtag < 1:645728‑M2/150‑124 (MQ=255) acaGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTc > 1:5334046/1‑81 (MQ=255) acaGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAg > 1:1809751/1‑115 (MQ=255) acaGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAg < 2:1809751/115‑1 (MQ=255) | GCCCGGGAAACCGCTCGCCCAGCATCTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGC‑‑CACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATT > NC_002947/1436521‑1436818 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |