| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2064575 = | 222 (0.920) | 14 (0.060) | 8/256 | NT | 6.6% | intergenic (+17/+107) | PP_1835/PP_1836 | hypothetical protein/ZIP family metal transporter |
| ? | NC_002947 | 2064656 = | 192 (0.850) | intergenic (+98/+26) | PP_1835/PP_1836 | hypothetical protein/ZIP family metal transporter | |||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GTTGCTCGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGCCCTGTGATAACCCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCTCACGAAACATCAATCTTCAGCCCAGCGCAGTGTCGAGAAACATCATCACCGCAAACCC > NC_002947/2064426‑2064723 | gTTGCTCGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGt > 2:3562157/1‑150 (MQ=255)gTTGCTCGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGt > 1:2233176/1‑150 (MQ=255) gCTCGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTcg < 1:1370740/150‑1 (MQ=255) cTCGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTcgc > 2:4664133/1‑150 (MQ=255) tgtggtcagccacgaggtgatccccgaaacccaccgcaacgggcaccagacagcggcgaccctggggttgatgggcgggtttgcggtgatgatgtttctcgacactgcgctgggctgaagattgatgtttcgtgagccggcctcTTcgcg < 2:5499951‑M1/6‑1 (MQ=255) tCGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTcgcg < 2:4842232/150‑1 (MQ=255) tCGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTcgcg > 2:5024869/1‑150 (MQ=255) cGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCgg < 1:4317663/150‑1 (MQ=255) cGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCgg < 2:1723988/150‑1 (MQ=255) cGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCgg > 2:1472913/1‑150 (MQ=255) cGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCgg < 2:726757/150‑1 (MQ=255) gATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCggg > 1:5039198/1‑150 (MQ=255) ggtcagccacgaggtgatccccgaaacccaccgcaacgggcaccagacagcggcgtccctggggttgatgggcgggtttgcggtgatgatgtttctcgacactgcgctgggctgaagattgatgtttcgtgagccggcctcTTCGCGGGc > 2:5089398‑M1/142‑150 (MQ=255) 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aCCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGcc < 2:939987/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGccc < 1:4906793/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCGGGCATGTCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGCCCt > 1:1204648/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGCCCtgt < 1:4007485/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGCCCTGTGAt < 2:209191/150‑1 (MQ=255) 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ttGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGCCCTGTGATAACCCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGCCGGCTCACGAAACATCAATCTTCAGCCCAGCGCAGTGTCGAGAACCCTCATCACCGCacac > 2:3613635/1‑150 (MQ=255) ttGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGCCCTGTGATAACCCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCTCACGAAACATCAATCTTCAGCCCAGCGCAGTGTCGAGAAACATCATCACCGCAAAc > 2:3381171/1‑150 (MQ=255) | GTTGCTCGATGACGAGCTGCAGATGGTCATGGTGGGGCAGCAGGACCTGGCGCGGGTAATGGAGTTGGGAGCAGAGCTGGGCATCAAGGTCGAGCCGGCGCTGGAGGCTTTGAAAGTCGCCGTCCACATCTGATACCAGTGATTGCTTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTACTCCAGCGCATCAGGCCCTGTGATAACCCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGCTCACGAAACATCAATCTTCAGCCCAGCGCAGTGTCGAGAAACATCATCACCGCAAACCC > NC_002947/2064426‑2064723 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |