| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2477132 | 69 (0.290) | 9 (0.040) | 4/228 | NT | 5.3% | intergenic (+44/+105) | PP_2166/PP_2167 | anti‑anti‑sigma factor/PhoD‑like phosphatase |
| ? | NC_002947 | = 4329770 | 263 (1.310) | intergenic (+142/+125) | pbpG/PP_3795 | murein D‑alanyl‑D‑alanine endopeptidase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCA > NC_002947/2476983‑2477279 | tggtgCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacga < 1:92801/150‑1 (MQ=255) tgCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACgg < 2:3919492/150‑1 (MQ=255) tCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTgc > 1:4391769/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTgcg‑c < 2:253204/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑ccc < 2:2606822/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCaaa < 1:2457775/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCAGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCaaa < 1:4884041/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAac < 1:1151298/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAacac < 2:5437375/150‑1 (MQ=255) gAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCa > 1:3294386/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCa < 1:436047/150‑1 (MQ=255) aGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacga < 1:590156/129‑1 (MQ=255) aGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCaa < 2:3526386/150‑1 (MQ=255) ggCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCCTGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGACGGCCTGCG‑CCCAAACCCCacg < 2:4914897/150‑3 (MQ=255) ggCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAAt < 2:1910842/150‑1 (MQ=255) gcgcACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCCCGCCAACGACGGCCTGCGCCCCAAAAACCagg > 2:2184207/1‑148 (MQ=255) cacaAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGGAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAAtgtgt < 1:2926760/150‑1 (MQ=255) cacaAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAAtgtgt < 2:4391769/150‑1 (MQ=255) 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ccTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCAccc < 1:917755/150‑1 (MQ=255) gggCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATc < 1:1825014/150‑1 (MQ=255) gCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAg < 2:3294386/150‑1 (MQ=255) cTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGgt < 2:2576831/150‑1 (MQ=255) cTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGgt < 1:295355/150‑1 (MQ=255) tGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTACAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcg < 2:75538‑M1/150‑48 (MQ=255) aaTGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCACTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTa < 2:4671656/150‑1 (MQ=255) gctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAg > 1:5154143‑M1/62‑150 (MQ=255) ccgccACCCGCGCCGCCTCCCATCCTCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCGGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCACCGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCACTGTGTGTCCACCCCCACTCAGGTGTAGGAg < 2:2957009/147‑1 (MQ=37) gcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGc > 2:3342793‑M1/58‑150 (MQ=255) tCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCAccc > 1:4604100/1‑131 (MQ=255) gggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttatAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCgg > 1:1057793‑M1/56‑150 (MQ=255) gggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCgg > 1:1025383‑M1/56‑150 (MQ=255) gggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCgg > 1:2720186‑M1/56‑150 (MQ=255) ccAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCgg < 1:3906238/150‑1 (MQ=255) 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cAACCGCGAAGCCTTCCATGGTCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcggg < 2:4952303‑M1/150‑58 (MQ=255) cgcgAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTa < 1:2394951/150‑1 (MQ=255) aaGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCcg < 1:2906026/150‑1 (MQ=255) cagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCggg > 1:4156094‑M1/43‑138 (MQ=255) ccATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCCGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 2:1328412/150‑1 (MQ=255) 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CTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCAGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCCATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCAGGCTGTAAAAACACGGGGTCACACTACGCCCGGGTTttaaaaa < 2:2924109‑M1/150‑3 (MQ=255) taggaGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAActc < 2:5500591‑M1/145‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgt > 1:3796352‑M1/1‑23 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgt > 1:3235490‑M1/1‑23 (MQ=255) TTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTGTAAACTCTg < 2:284465‑M1/150‑1 (MQ=255) gagcgggTTTACCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgtt > 1:307228‑M1/3‑22 (MQ=255) CGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTa < 2:4258303‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttcc > 2:187713‑M1/1‑20 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttcca < 1:3794771‑M1/150‑132 (MQ=255) CGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGc < 1:421614‑M1/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccagga < 2:5530303‑M1/150‑135 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggata > 1:2815806‑M1/1‑14 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatat > 2:3056824‑M1/1‑13 (MQ=255) aCCCGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatg < 2:4611562‑M1/150‑139 (MQ=255) ACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccc < 2:321525‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccc < 2:605941‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccc < 2:4983847‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccc < 1:4998556‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTACTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACAAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccc < 2:1484940‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatgg > 1:3083757‑M1/1‑11 (MQ=255) cccGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtgtcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctctccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatgg < 2:3622472‑M1/150‑140 (MQ=255) CCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAcccc < 2:4151804‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAcccc < 1:1817004‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatggc > 1:3217468‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatggc > 1:2240299‑M1/1‑10 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccccc < 2:441756‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccccc < 2:4780970‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccccc < 1:1848521‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccccc < 2:51931‑M1/150‑1 (MQ=255) cGCTCCGACacctgataggggctggatacacatgggcgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggttgcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatggcg < 2:1213485‑M1/150‑142 (MQ=255) gCTCCTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatggcgg > 2:910198‑M1/1‑8 (MQ=255) TCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCa < 2:4048609‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTACacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatggcggtca > 1:1311045‑M1/1‑5 (MQ=255) CTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGc < 1:4427929‑M1/150‑1 (MQ=255) acacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatggcggtcattc < 2:2147018‑M1/150‑149 (MQ=255) acacctgattgggggtggatacacattggtgattgggcgcaggccgtcgtaggcgcgggtttcctcgcgaacacggacgaagcccgtgctatccgccgcgttgtctgcttcgcggacaagcccgcacgttccaggatatggcggtcattc < 1:3935843‑M1/150‑149 (MQ=255) | TGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCG‑CCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCA > NC_002947/2476983‑2477279 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |