| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
ACAGTAGCAACGCACCAGTTCGATGATCTGTCGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTA > NC_002947/3350829‑3351127 | aCAGTAGCAACGCACCAGTTCGATGATCTGTCGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTctg < 2:1039078/150‑1 (MQ=255) cAGTAGCAACGCACCAGTTCGATGATCTGTCGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTctgc < 1:705941/150‑1 (MQ=255) ggaGCAACGCACCAGTTCGATGATCTGTCGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTctgctg < 2:1494416/148‑1 (MQ=255) 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tgtgTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCt > 2:2947153/1‑150 (MQ=255) tgtgTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCt > 1:3833422/1‑150 (MQ=255) gtTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTcgc < 2:5077321/150‑1 (MQ=255) tttCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTcgcg > 2:1814533/1‑150 (MQ=255) cAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTc < 2:368441/150‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTc > 1:1382183/1‑150 (MQ=255) cAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTc < 2:4951557/150‑1 (MQ=255) actgctcaataacgacttggagaaacgcGTTGCAGC‑CCGTACCGCGGAGCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGGTCTGCCGTCGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGGTCGGAATGCTgg < 2:3991488‑M1/122‑1 (MQ=255) aGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGt < 1:1111321/150‑1 (MQ=255) aGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGt < 1:1973838/150‑1 (MQ=255) ccAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCt > 1:1950460/1‑150 (MQ=255) gAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGc > 1:5106500/1‑150 (MQ=255) cATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTg < 2:3547706/150‑1 (MQ=255) aTGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTgg < 1:1236903/150‑1 (MQ=255) agtggTCTGCTGCATCTCCGCGGTACGG‑GCAGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGACGACGTGCCAGCAGCACCAGCCGGTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCAGGCGCaa > 1:3891738/4‑150 (MQ=255) agtggTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCaa > 1:913319/4‑150 (MQ=255) aGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCaa > 1:1494209/1‑150 (MQ=255) aGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCaa < 1:1037356/150‑1 (MQ=255) tgctgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAtt < 1:3188792/150‑1 (MQ=255) tgctgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAtt < 2:4568736/150‑1 (MQ=255) tgctgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAtt > 1:4294033/1‑150 (MQ=255) tgctgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAtt < 2:5560687/150‑1 (MQ=255) tgctgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAtt < 1:3689546/150‑1 (MQ=255) GCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTa > 2:1546708‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTa > 1:5229576‑M1/1‑150 (MQ=255) | ACAGTAGCAACGCACCAGTTCGATGATCTGTCGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTA > NC_002947/3350829‑3351127 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |