| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3350978 = | 190 (0.790) | 11 (0.050) | 8/272 | NT | 5.5% | coding (514/1371 nt) | PP_2942 | two‑component system response regulator |
| ? | NC_002947 | 3351006 = | 193 (0.800) | coding (486/1371 nt) | PP_2942 | two‑component system response regulator | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TGTCGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACT > NC_002947/3350857‑3351155 | aatgaccttgcgccaggccctggagcaccagcattccgaacgcgagcgccaacgcctggagctgctggcacgtcggcagaacgcccagttgagactgctcaataacgacttggagaaacgcGTTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAAcg > 1:446008‑M1/122‑150 (MQ=255) tCGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAAcgcg > 2:5229579/1‑150 (MQ=255) cGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGt < 2:3072095/150‑1 (MQ=255) gATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGtt > 2:2875481/1‑150 (MQ=255) aTTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGttt < 2:4014054/150‑1 (MQ=255) gTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTcc > 1:4937302/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCaa < 2:1128966/150‑1 (MQ=255) cTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCaa < 1:2838817/150‑1 (MQ=255) ttGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCg > 1:4866685/1‑150 (MQ=255) ttGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCg > 1:1557008/1‑150 (MQ=255) ggCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTTTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAAcgc < 1:5309019/134‑1 (MQ=255) ggCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGGGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAAcgc > 2:5309019/1‑134 (MQ=255) cTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTAt > 1:691153/1‑150 (MQ=255) gAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGa < 2:1980072/150‑1 (MQ=255) gAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGa > 1:5131714/1‑150 (MQ=255) aGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAg < 2:4677140/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCa > 2:5022316/1‑150 (MQ=255) aGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGt < 1:2968779/150‑1 (MQ=255) 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aGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGc < 1:5557490/150‑1 (MQ=255) aGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGc < 1:1968823/150‑1 (MQ=255) aaCATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCGGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTc > 2:2069660/1‑150 (MQ=255) cATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTg < 2:1906298/150‑1 (MQ=255) cATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTg > 2:4622253/1‑150 (MQ=255) aTCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGc > 2:2769028/1‑150 (MQ=255) gagaACACCTCGGTCACGGTCACATAGCTTTGTGTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGAATGTCAGCGGGCTGCTGCAGCTCCGCGGAACGG‑GCTGCAACGCGTTACACCAAGACGTAATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGa > 2:3203900/1‑150 (MQ=255) aaCACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGt < 1:2541466/150‑1 (MQ=255) cacCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGc < 1:5114031/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCca < 1:406399/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCca < 1:4530598/150‑1 (MQ=255) cTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCcag > 2:2475948/1‑150 (MQ=255) cTCGGACCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCcag > 2:722232/1‑150 (MQ=255) cGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCcagca > 1:671226/1‑150 (MQ=255) tCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCt > 2:1431879/1‑150 (MQ=255) 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aGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCg < 2:2244188/150‑1 (MQ=255) gCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCgg > 2:184530/1‑150 (MQ=255) ctctTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGa > 1:3638853/1‑150 (MQ=255) ctctTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGa > 2:5128126/1‑150 (MQ=255) tctTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGaa > 2:1331664/1‑150 (MQ=255) 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tgctgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAtt < 2:1309958/150‑1 (MQ=255) tgctgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAtt < 2:4568736/150‑1 (MQ=255) gcgttgcagcccgtaccgcggagctgcagcGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAt > 1:130267‑M2/31‑150 (MQ=255) cgttgcagcccgtaccgcggagctgcagcGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGc < 1:3972155‑M2/68‑1 (MQ=255) GCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTa > 1:5229579‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTa > 2:1546708‑M1/1‑150 (MQ=255) gttgcagcccgtaccgcggagctgcaacGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTa > 2:451995‑M2/29‑150 (MQ=255) gttgcagcccgtaccgcggagctgcaacGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTa > 1:3138035‑M2/29‑150 (MQ=255) ctgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAg > 1:285622/1‑150 (MQ=255) tgcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGc > 1:3126745/1‑150 (MQ=255) gcAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGATGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCCCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCa < 2:2753926/150‑1 (MQ=255) aGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAAt < 1:4962365/150‑1 (MQ=255) cTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtc < 1:2275310/150‑1 (MQ=255) tCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcg > 2:2452793/1‑150 (MQ=255) tCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcg > 1:4632700/1‑150 (MQ=255) ccGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcgt < 2:691153/150‑1 (MQ=255) cgcgGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcgtc < 2:3946174/150‑1 (MQ=255) cgcgGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTAATGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcgtc < 2:336429/150‑1 (MQ=255) cgGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcgtcgt > 1:1399880/1‑150 (MQ=255) ggTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcgtcgtc < 2:2624391/150‑1 (MQ=255) gTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATtcgtcgtcg > 2:5186091/1‑150 (MQ=255) gCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAg > 2:1708118/1‑150 (MQ=255) gCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGGTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCAGTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAg > 2:5351666/1‑150 (MQ=255) tGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAggg < 2:4866685/150‑1 (MQ=255) tGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAggg < 1:4090558/150‑1 (MQ=255) aCGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTa < 2:4294033/150‑1 (MQ=255) gcgTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACt > 2:3733013/1‑150 (MQ=255) | TGTCGATTGGTCTGCTTGGCTGGAGGCAGCCGCAGATTAGCCAACATCGAGAACACCTCGGTCCCGGTCACATAGCTGTGTTTCAGCTCTTCGTAGGCCAGATCGAGCATGTCAGCGGTCTGCTGCAGCTCCGCGGTACGG‑GCTGCAACGCGTTTCTCCAAGTCGTTATTGAGCAGTCTCAACTGGGCGTTCTGCCGACGTGCCAGCAGCTCCAGGCGTTGGCGCTCGCGTTCGGAATGCTGGTGCTCCAGGGCCTGGCGCAAGGTCATTAGCAATTCGTCGTCGTTCCAGGGCTTACT > NC_002947/3350857‑3351155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |