New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4582816 = | 220 (0.910) | 23 (0.100) | 12/262 | NT | 10.3% | intergenic (+32/+77) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
? | NC_002947 | 4582856 = | 189 (0.820) | intergenic (+72/+37) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
GTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTG > NC_002947/4582668‑4582965 | gtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagacccgtTc > 1:541830‑M1/149‑150 (MQ=255) gtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagacccgtTc > 1:1064783‑M1/149‑150 (MQ=255) gtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagacccgtTc > 1:2663913‑M1/149‑150 (MQ=255) tcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagacccgtTcc < 1:3090706‑M1/3‑1 (MQ=255) gcgGGTGACGCCTGCGGTGGCGTTGTACGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACCATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAATCCCGCTCCTcca > 2:5542688/1‑150 (MQ=255) gTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggg < 2:3066427/150‑1 (MQ=255) cGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAc < 2:5057880/150‑1 (MQ=255) gCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGACCGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACTCGGTTCAcc < 2:4699236/150‑1 (MQ=255) gCCTTCGGTGGCGTTGGTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAcc < 2:2981058/150‑1 (MQ=255) ttCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAccgcc > 2:4265438/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAccgcc > 2:153777/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCgg < 2:2508061/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCgg < 1:5570938/150‑1 (MQ=255) 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cacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagacccgcTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACgg > 1:1454448‑M1/107‑150 (MQ=255) cacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagacccgcTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACgg > 2:753594‑M1/107‑150 (MQ=255) acgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggcagggccggccccttcgcgggtaaacccgcTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACgg > 1:3812887‑M1/107‑150 (MQ=255) cagcagTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGtctc > 2:3189425/1‑150 (MQ=255) cagcagTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGtctc < 2:3946935/150‑1 (MQ=255) gTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCcgcg < 2:3850982/150‑1 (MQ=255) tGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGa > 1:5322582/1‑150 (MQ=255) gATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaa < 1:3251284/150‑1 (MQ=255) gATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaa < 1:48528/150‑1 (MQ=255) tggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagacccgtTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACgg > 2:180749‑M1/88‑131 (MQ=255) aTGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa < 1:783059/150‑1 (MQ=255) aTGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa < 1:1093253/150‑1 (MQ=255) aTGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa < 2:4582963/150‑1 (MQ=255) tGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAg > 2:3568571/1‑150 (MQ=255) tGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAg > 2:4925084/1‑150 (MQ=255) 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gTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAacac < 1:4265438/150‑1 (MQ=255) cGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACAcccc < 2:5096883/150‑1 (MQ=255) ggATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCGACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACAccccc > 1:1263539/1‑150 (MQ=255) gCGGTGGTAGCCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAAcg > 2:4785583/1‑150 (MQ=255) tggtAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAAcggcgg > 1:3139920/1‑150 (MQ=255) tggtAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAAcggcgg < 2:4993695/150‑1 (MQ=255) ggtAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACggcggc < 1:1993592/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCCACACCCCCAACGGCGGCAGGtt > 2:4410488/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGtt > 1:24071/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGtt > 2:4231472/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTc < 1:3465831/150‑1 (MQ=255) ctttcgcgggggacccgtTCCTACGCAGG‑CACCGCACCCGGCGGTGACCCGTGTAGGAGCGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGAt < 2:1953208‑M1/132‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATa > 2:4480784/1‑150 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAAt < 2:3355421/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTg > 2:648772/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGccc < 2:2059737/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGt > 1:4798769/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGt > 1:395827/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGtg > 2:855077/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGtg > 2:4604654/1‑150 (MQ=255) 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TCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGtggctg < 1:4349759‑M1/150‑1 (MQ=255) | GTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTG‑CCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGCTG > NC_002947/4582668‑4582965 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |