New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4875660 = | 183 (0.760) | 12 (0.060) | 5/224 | NT | 8.6% | intergenic (+16/‑104) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
? | NC_002947 | 4875730 = | 107 (0.540) | intergenic (+86/‑34) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CTGATTACCGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGG > NC_002947/4875511‑4875807 | ccatcttcgagcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgg > 2:4051558‑M1/150‑150 (MQ=255) gATTACCGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTa < 2:4288732/150‑1 (MQ=255) gATTACCGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTa < 2:2408784/150‑1 (MQ=255) tcttcgagcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAg > 2:3740259‑M1/147‑150 (MQ=255) ttcgagcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGa > 2:3161401‑M1/145‑150 (MQ=255) ttcgagcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGa < 2:1900754‑M1/6‑1 (MQ=255) cgagcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGc < 1:3788121‑M1/8‑1 (MQ=255) ccGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGc > 2:1726499/1‑150 (MQ=255) cgcgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCg > 1:4623478/1‑150 (MQ=255) gcgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCgg < 1:4558054/150‑1 (MQ=255) gcgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCgg > 2:5116072/1‑150 (MQ=255) gcgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCgg < 2:3371425/150‑1 (MQ=255) agcctgcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCgg > 2:121880‑M1/141‑150 (MQ=255) cgTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCggg < 2:4412224/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGt < 2:643060/150‑1 (MQ=255) gcgttgcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTa > 2:1460487‑M1/136‑150 (MQ=255) aGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGgtttc > 1:4829613/1‑148 (MQ=255) aGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTAc > 2:1349327/1‑150 (MQ=255) 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gcgcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGTGGGTTTACCcgc > 1:2605189‑M1/131‑150 (MQ=255) gCAGGTGGAGGCGCCGGCACCGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:2149853/150‑1 (MQ=255) gcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa < 2:753230‑M1/22‑1 (MQ=255) gcggggtagagccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa < 1:1464122‑M1/22‑1 (MQ=255) ggggtagagccgcgctcttcgatgagggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAt > 1:352794‑M1/127‑150 (MQ=255) ggATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGGTTTCCCGCGAAAGc > 1:4693793/1‑150 (MQ=255) gATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAATGCg > 2:1992596/1‑150 (MQ=255) aTGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGa < 2:2570683/150‑1 (MQ=255) aTGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGa < 2:5622087/150‑1 (MQ=255) agccgcgctcttcgatgatggtcaccagcacgcaggcttcgccacgggactggtggtcggcgagggcgttgatccattggtgcatgatgcaacctctctaagccatgctgccgaccctgGTAGGAGc > 2:3817809‑M1/120‑127 (MQ=255) gcCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATc > 2:4799835/1‑150 (MQ=255) gcCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATc < 1:476963/150‑1 (MQ=255) ggCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGc < 2:403052/150‑1 (MQ=255) gCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCt < 2:5475839/150‑1 (MQ=255) cAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTc < 1:5260482/150‑1 (MQ=255) 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1:4035227/1‑90 (MQ=255) ggAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAACAGGGTCGGCAGCATGGGTTTGAGAGGTTGGATCATGCAc > 2:1677868/1‑150 (MQ=255) cTGGAAACCATCACCCCCTGACCACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCact < 2:4926550/150‑3 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGATATGACCGCCAAAGCGACAATCGCGGGTTAAACCGCTCCAGCCCGGGTCGGCAGCATGGGGTTGGGACGGTTCATGATGCAcccaag > 1:203303/1‑146 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATg < 2:2450135/150‑1 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGTTGCATCATGCACCaaag > 2:684140/1‑148 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATg > 1:2274866/1‑150 (MQ=255) ggAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTAACCCCGGATGCGATATCAGCTCCAAAGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCACCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGTTGCATCAAGCACCAATgg > 1:1298883/1‑150 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGa < 2:2163346/150‑1 (MQ=255) ccATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCaa < 2:3208514/150‑1 (MQ=255) cATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAAc < 1:1349327/150‑1 (MQ=255) ccccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCGACATTCGCGGGTAAAACCCCTCCTACCAGGGTAGGCAGCAAGGCGTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGcccac > 1:3271218/1‑148 (MQ=255) cccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCATGCGATATCAGCTCCAAAGCGACATTAGCGGGTAAAACCCCACCGAACAGGGGGGGCCGCAAGGCGTGTAGAGGTTGCATCATGCACCAAAGGATAAAAGCCcgcg > 1:2162611/1‑150 (MQ=255) cccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGCTATCAGCTCCAACGCGACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGGTGCATCATGCACCAATGGATCCACGCCCTCg > 2:3538495/1‑150 (MQ=255) cccTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACCAGGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATAAACGCCCTcc > 2:257644/1‑149 (MQ=255) aCAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACAGTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGac < 1:3649780/150‑1 (MQ=255) aCAACCCACGGCCCTTGTAGGAGCGGTTTTCCCCGCTAATGCGAAATCAGCCCAAACGCTAATTTCGGGGTTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGac < 1:161481/150‑1 (MQ=255) aCGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCGATATCAGCTCCAACGCTACTTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGaccac < 1:2435052/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAg > 2:5034407/1‑150 (MQ=255) ggCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTcc > 2:3974763/1‑150 (MQ=255) cccTTTTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGATACATTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCg < 1:3147748/150‑1 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGt < 2:2059157/150‑1 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGGGAACCCGCTCCGACCAGGGTCGGCAGCATGGCATAGAGAGGTTGGATAATGCACCAAAGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTACCGt > 2:4262697/1‑150 (MQ=255) cTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCTAATGCTATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTg < 1:1992596/150‑1 (MQ=255) cTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCCGTCCCgag > 2:4184047/1‑148 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGGGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTgg < 1:4799835/150‑1 (MQ=255) | CTGATTACCGCGTGCAGCCGCAGGTGGATGCGCCGGCAACGCCGGAGCGGGTGCTGTGGGGCTGCGAGCAGATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGG > NC_002947/4875511‑4875807 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |