New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4875660 = | 183 (0.760) | 12 (0.060) | 5/224 | NT | 8.6% | intergenic (+16/‑104) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
? | NC_002947 | 4875730 = | 107 (0.540) | intergenic (+86/‑34) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
ATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATGGT > NC_002947/4875582‑4875879 | tGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAg > 1:4142919/1‑150 (MQ=255) gcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCACGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCAGGCGAGATCAGCGCCAACGCGCCATGCGCGGGTCAACCCGCGCCTACCAgggg > 2:1460329/1‑149 (MQ=255) gcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGt < 1:3655203/150‑1 (MQ=255) cAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTc < 2:3647804/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGCTGAACCACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACACCGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGgca < 2:3266078/150‑1 (MQ=255) gTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAATGCGAGATCAGCTCCAACGCTACAGTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACCCGGGTCGgcagca > 2:5035566/1‑150 (MQ=255) aaaCACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTa > 2:3428062/1‑150 (MQ=255) aaaCACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTa < 2:4675847/150‑1 (MQ=255) aaaCACAGACGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTa < 1:5460110/150‑1 (MQ=255) acacAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTaga < 2:1325054/150‑1 (MQ=255) ccaGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCACCACCCCCTCCCAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACTGCGATGTCAGCACCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTagaga < 2:2609338/149‑1 (MQ=38) acaGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTagaga < 2:443196/150‑1 (MQ=255) acaGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCACCAAAGCTACATTAGCGGGTAAACCCCCGCCAACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTagaga > 1:1215324/1‑150 (MQ=255) caGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTAGATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTagagag < 1:3282730/150‑1 (MQ=255) aGTCGCGCGAACGGGAACTGCAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCGTTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAATGCGATACCCGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAgg < 1:3883727/150‑1 (MQ=39) gcgcgcgAAGGGGAACTGCAAACCACCCCCCCCTGACACCGCACGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCTATTGCGATATCCGCTCCAACGCTACTTTCGCGGGAAACCCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGtt < 1:4761084/149‑1 (MQ=255) gAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTTAACCCGGAGGCGATATCAGCTCCCACCCGACAATCGCGGGTGAAACCCCCCCCACCAGGGGCGGCCGCAAGGCGTAGAGAGGTTgggtaa > 1:935574/1‑145 (MQ=255) gAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGcatca < 2:4623478/150‑1 (MQ=255) cGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGc < 2:1220840/150‑1 (MQ=255) gggAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGTTGCCTCATGcc > 2:5403001/1‑149 (MQ=255) gAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCAcc > 2:4806759/1‑150 (MQ=255) gAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGATCAGCTCCAACGCGACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCCTGCAcc > 2:1999655/1‑150 (MQ=255) cTGGAAACCATCACCCCCTGACCACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCact < 2:4926550/150‑3 (MQ=255) cTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAAt < 1:5116072/150‑1 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCATGCGAGATCAGCTCCAACGCGACATTCGCGGGTAAACCCCCGCCGACCAGGGTCGGCCGCAGGGCGTAGAGAGGGTGCCTCATGCACCAATg > 1:346775/1‑150 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGATATGACCGCCAAAGCGACAATCGCGGGTTAAACCGCTCCAGCCCGGGTCGGCAGCATGGGGTTGGGACGGTTCATGATGCAcccaag > 1:203303/1‑146 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATg > 1:1606812/1‑150 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGTTGCATCATGCACCaaag > 2:684140/1‑148 (MQ=255) tGGAAACCATCACCCCCTCACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATg < 2:2530552/150‑1 (MQ=255) ggAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTAACCCCGGATGCGATATCAGCTCCAAAGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCACCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGTTGCATCAAGCACCAATgg > 1:1298883/1‑150 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTATAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGa > 2:3287426/1‑150 (MQ=255) gAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGGTTACCCCCCACTGCGATATCAGCGCCAACGCGACATTCGCGGGGAAACCCGCGCCAACCCGGGTCGGCAGCAAGGCGTAGAGAGGGCGCATCATGCACCAATggc > 1:2809871/1‑149 (MQ=255) gAAACCAGCACCCCCTGACAACGCACGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCACCGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGa < 2:5549/150‑1 (MQ=255) 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gACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGa < 1:4381210/150‑1 (MQ=255) aaCGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATAAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTAAGTGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGacca > 2:2302164/1‑150 (MQ=255) ccGCACGGCCCTTGTTGGTGGGGGTTTCCCCGCGAATGCGATATCCGCTCCAACGCTACATTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGaccac < 1:133890/149‑1 (MQ=255) aCGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATTCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCAGGGCGTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGCTCAACGCCCGCGCCGaccac > 2:4526614/1‑150 (MQ=39) aCGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCGATATCAGCTCCAACGCTACTTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGaccac < 1:2435052/150‑1 (MQ=255) 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atCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGaa < 1:1726499/150‑1 (MQ=255) tCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAag > 1:3271205/1‑150 (MQ=255) cAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCgg > 1:5079274/1‑150 (MQ=255) tACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTAc > 2:3808225/1‑150 (MQ=255) tACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTAc > 2:3348189/1‑150 (MQ=255) tACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTAc > 2:2903582/1‑150 (MQ=255) tcgcgggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCcgc < 1:3644278‑M2/128‑1 (MQ=255) tcgcgggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCcgc < 1:1464122‑M2/128‑1 (MQ=255) tcgcgggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCcgc < 2:1215324‑M2/128‑1 (MQ=255) gggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCaa > 2:750498‑M2/19‑150 (MQ=255) ggtaaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAAc > 2:2963137‑M2/18‑150 (MQ=255) taaacccgctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGc < 2:431327‑M2/135‑1 (MQ=255) gctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGct < 1:3817809‑M2/119‑1 (MQ=255) gctcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCg < 1:3788121‑M2/142‑1 (MQ=255) tcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGaa < 2:1900754‑M2/144‑1 (MQ=255) tcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGaa < 2:2162611‑M2/144‑1 (MQ=255) tcctacCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGaa > 2:3161401‑M2/7‑150 (MQ=255) acCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTCGCATCATGCACCAATGGa < 2:5060606‑M2/47‑1 (MQ=255) cCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATgg > 2:1552999‑M2/2‑150 (MQ=255) cCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATgg > 2:4051375‑M2/2‑150 (MQ=255) cAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTCCCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGAtggt > 1:3387739/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGAtggt > 2:1056295/1‑150 (MQ=255) | ATGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATGGT > NC_002947/4875582‑4875879 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |